Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN16

Hhip, Hedgehog-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HhipQ7TN16 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HhipQ7TN16 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HhipQ7TN16 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HhipQ7TN16 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HhipQ7TN16 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HhipQ7TN16 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HhipQ7TN16 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HhipQ7TN16 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HhipQ7TN16 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HhipQ7TN16 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HhipQ7TN16 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HhipQ7TN16 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HhipQ7TN16 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HhipQ7TN16 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HhipQ7TN16 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HhipQ7TN16 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HhipQ7TN16 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HhipQ7TN16 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HhipQ7TN16 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HhipQ7TN16 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HhipQ7TN16 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HhipQ7TN16 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HhipQ7TN16 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HhipQ7TN16 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HhipQ7TN16 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HhipQ7TN16 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HhipQ7TN16 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HhipQ7TN16 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HhipQ7TN16 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HhipQ7TN16 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HhipQ7TN16 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HhipQ7TN16 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HhipQ7TN16 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HhipQ7TN16 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HhipQ7TN16 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HhipQ7TN16 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HhipQ7TN16 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HhipQ7TN16 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HhipQ7TN16 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HhipQ7TN16 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HhipQ7TN16 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HhipQ7TN16 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HhipQ7TN16 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HhipQ7TN16 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HhipQ7TN16 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HhipQ7TN16 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HhipQ7TN16 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HhipQ7TN16 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HhipQ7TN16 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HhipQ7TN16 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HhipQ7TN16 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HhipQ7TN16 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HhipQ7TN16 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HhipQ7TN16 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HhipQ7TN16 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HhipQ7TN16 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HhipQ7TN16 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HhipQ7TN16 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HhipQ7TN16 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HhipQ7TN16 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HhipQ7TN16 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HhipQ7TN16 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HhipQ7TN16 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HhipQ7TN16 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HhipQ7TN16 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HhipQ7TN16 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HhipQ7TN16 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HhipQ7TN16 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HhipQ7TN16 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HhipQ7TN16 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HhipQ7TN16 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HhipQ7TN16 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HhipQ7TN16 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HhipQ7TN16 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HhipQ7TN16 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HhipQ7TN16 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HhipQ7TN16 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HhipQ7TN16 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HhipQ7TN16 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HhipQ7TN16 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HhipQ7TN16 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HhipQ7TN16 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HhipQ7TN16 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HhipQ7TN16 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HhipQ7TN16 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HhipQ7TN16 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HhipQ7TN16 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HhipQ7TN16 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HhipQ7TN16 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HhipQ7TN16 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HhipQ7TN16 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HhipQ7TN16 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HhipQ7TN16 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HhipQ7TN16 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HhipQ7TN16 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HhipQ7TN16 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HhipQ7TN16 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HhipQ7TN16 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HhipQ7TN16 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HhipQ7TN16 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms