Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMD7

Dsg4, Desmoglein-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,041 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg4Q7TMD7 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dsg4Q7TMD7 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dsg4Q7TMD7 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dsg4Q7TMD7 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dsg4Q7TMD7 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dsg4Q7TMD7 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dsg4Q7TMD7 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dsg4Q7TMD7 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dsg4Q7TMD7 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dsg4Q7TMD7 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dsg4Q7TMD7 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dsg4Q7TMD7 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dsg4Q7TMD7 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.06
Dsg4Q7TMD7 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dsg4Q7TMD7 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dsg4Q7TMD7 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dsg4Q7TMD7 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dsg4Q7TMD7 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dsg4Q7TMD7 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dsg4Q7TMD7 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dsg4Q7TMD7 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dsg4Q7TMD7 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dsg4Q7TMD7 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dsg4Q7TMD7 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dsg4Q7TMD7 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Dsg4Q7TMD7 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dsg4Q7TMD7 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dsg4Q7TMD7 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dsg4Q7TMD7 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dsg4Q7TMD7 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dsg4Q7TMD7 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dsg4Q7TMD7 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dsg4Q7TMD7 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dsg4Q7TMD7 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dsg4Q7TMD7 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dsg4Q7TMD7 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dsg4Q7TMD7 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dsg4Q7TMD7 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dsg4Q7TMD7 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dsg4Q7TMD7 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dsg4Q7TMD7 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dsg4Q7TMD7 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dsg4Q7TMD7 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dsg4Q7TMD7 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dsg4Q7TMD7 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dsg4Q7TMD7 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dsg4Q7TMD7 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dsg4Q7TMD7 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Dsg4Q7TMD7 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dsg4Q7TMD7 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dsg4Q7TMD7 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dsg4Q7TMD7 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dsg4Q7TMD7 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dsg4Q7TMD7 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dsg4Q7TMD7 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dsg4Q7TMD7 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dsg4Q7TMD7 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dsg4Q7TMD7 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dsg4Q7TMD7 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dsg4Q7TMD7 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dsg4Q7TMD7 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dsg4Q7TMD7 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dsg4Q7TMD7 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dsg4Q7TMD7 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dsg4Q7TMD7 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dsg4Q7TMD7 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dsg4Q7TMD7 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dsg4Q7TMD7 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dsg4Q7TMD7 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dsg4Q7TMD7 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dsg4Q7TMD7 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dsg4Q7TMD7 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dsg4Q7TMD7 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dsg4Q7TMD7 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dsg4Q7TMD7 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dsg4Q7TMD7 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dsg4Q7TMD7 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dsg4Q7TMD7 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dsg4Q7TMD7 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dsg4Q7TMD7 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dsg4Q7TMD7 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dsg4Q7TMD7 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dsg4Q7TMD7 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Dsg4Q7TMD7 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dsg4Q7TMD7 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Dsg4Q7TMD7 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dsg4Q7TMD7 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dsg4Q7TMD7 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dsg4Q7TMD7 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dsg4Q7TMD7 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dsg4Q7TMD7 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dsg4Q7TMD7 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dsg4Q7TMD7 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dsg4Q7TMD7 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dsg4Q7TMD7 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dsg4Q7TMD7 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dsg4Q7TMD7 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dsg4Q7TMD7 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dsg4Q7TMD7 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dsg4Q7TMD7 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms