Protein–RNA interactions for Protein: Q7M729

Scn4b, Sodium channel subunit beta-4, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn4bQ7M729 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn4bQ7M729 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn4bQ7M729 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn4bQ7M729 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn4bQ7M729 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scn4bQ7M729 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scn4bQ7M729 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scn4bQ7M729 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scn4bQ7M729 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scn4bQ7M729 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scn4bQ7M729 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scn4bQ7M729 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scn4bQ7M729 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scn4bQ7M729 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scn4bQ7M729 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scn4bQ7M729 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scn4bQ7M729 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scn4bQ7M729 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scn4bQ7M729 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scn4bQ7M729 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scn4bQ7M729 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scn4bQ7M729 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scn4bQ7M729 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scn4bQ7M729 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scn4bQ7M729 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scn4bQ7M729 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scn4bQ7M729 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scn4bQ7M729 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scn4bQ7M729 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scn4bQ7M729 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scn4bQ7M729 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scn4bQ7M729 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scn4bQ7M729 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scn4bQ7M729 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scn4bQ7M729 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scn4bQ7M729 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scn4bQ7M729 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scn4bQ7M729 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scn4bQ7M729 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scn4bQ7M729 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scn4bQ7M729 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scn4bQ7M729 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scn4bQ7M729 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scn4bQ7M729 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scn4bQ7M729 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scn4bQ7M729 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scn4bQ7M729 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scn4bQ7M729 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scn4bQ7M729 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scn4bQ7M729 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scn4bQ7M729 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Scn4bQ7M729 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scn4bQ7M729 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scn4bQ7M729 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scn4bQ7M729 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scn4bQ7M729 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scn4bQ7M729 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scn4bQ7M729 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scn4bQ7M729 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scn4bQ7M729 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scn4bQ7M729 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scn4bQ7M729 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scn4bQ7M729 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scn4bQ7M729 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scn4bQ7M729 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scn4bQ7M729 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scn4bQ7M729 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scn4bQ7M729 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scn4bQ7M729 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scn4bQ7M729 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scn4bQ7M729 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scn4bQ7M729 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scn4bQ7M729 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Scn4bQ7M729 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Scn4bQ7M729 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scn4bQ7M729 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Scn4bQ7M729 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scn4bQ7M729 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scn4bQ7M729 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scn4bQ7M729 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scn4bQ7M729 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scn4bQ7M729 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scn4bQ7M729 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scn4bQ7M729 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scn4bQ7M729 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scn4bQ7M729 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scn4bQ7M729 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scn4bQ7M729 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scn4bQ7M729 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scn4bQ7M729 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scn4bQ7M729 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scn4bQ7M729 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scn4bQ7M729 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scn4bQ7M729 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scn4bQ7M729 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scn4bQ7M729 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scn4bQ7M729 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scn4bQ7M729 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scn4bQ7M729 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scn4bQ7M729 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms