Protein–RNA interactions for Protein: Q70IV5

Synm, Synemin, mousemouse

Predictions only

Length 1,561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynmQ70IV5 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SynmQ70IV5 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SynmQ70IV5 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SynmQ70IV5 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SynmQ70IV5 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SynmQ70IV5 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SynmQ70IV5 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SynmQ70IV5 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SynmQ70IV5 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SynmQ70IV5 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SynmQ70IV5 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SynmQ70IV5 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SynmQ70IV5 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SynmQ70IV5 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SynmQ70IV5 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SynmQ70IV5 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SynmQ70IV5 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SynmQ70IV5 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SynmQ70IV5 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SynmQ70IV5 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SynmQ70IV5 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SynmQ70IV5 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SynmQ70IV5 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SynmQ70IV5 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SynmQ70IV5 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SynmQ70IV5 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SynmQ70IV5 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SynmQ70IV5 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SynmQ70IV5 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SynmQ70IV5 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SynmQ70IV5 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SynmQ70IV5 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SynmQ70IV5 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SynmQ70IV5 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SynmQ70IV5 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SynmQ70IV5 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SynmQ70IV5 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SynmQ70IV5 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SynmQ70IV5 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SynmQ70IV5 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SynmQ70IV5 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SynmQ70IV5 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SynmQ70IV5 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SynmQ70IV5 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SynmQ70IV5 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SynmQ70IV5 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SynmQ70IV5 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SynmQ70IV5 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SynmQ70IV5 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SynmQ70IV5 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SynmQ70IV5 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SynmQ70IV5 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SynmQ70IV5 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SynmQ70IV5 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SynmQ70IV5 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SynmQ70IV5 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SynmQ70IV5 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SynmQ70IV5 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SynmQ70IV5 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SynmQ70IV5 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SynmQ70IV5 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SynmQ70IV5 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SynmQ70IV5 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SynmQ70IV5 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SynmQ70IV5 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SynmQ70IV5 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SynmQ70IV5 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SynmQ70IV5 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SynmQ70IV5 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SynmQ70IV5 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SynmQ70IV5 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SynmQ70IV5 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SynmQ70IV5 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SynmQ70IV5 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SynmQ70IV5 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SynmQ70IV5 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SynmQ70IV5 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SynmQ70IV5 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SynmQ70IV5 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SynmQ70IV5 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SynmQ70IV5 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SynmQ70IV5 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SynmQ70IV5 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SynmQ70IV5 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SynmQ70IV5 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SynmQ70IV5 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SynmQ70IV5 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SynmQ70IV5 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SynmQ70IV5 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SynmQ70IV5 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SynmQ70IV5 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SynmQ70IV5 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SynmQ70IV5 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SynmQ70IV5 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SynmQ70IV5 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SynmQ70IV5 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SynmQ70IV5 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SynmQ70IV5 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SynmQ70IV5 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SynmQ70IV5 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms