Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ12

Ninl, Ninein-like protein, mousemouse

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Length 1,394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NinlQ6ZQ12 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NinlQ6ZQ12 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NinlQ6ZQ12 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NinlQ6ZQ12 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NinlQ6ZQ12 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NinlQ6ZQ12 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NinlQ6ZQ12 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NinlQ6ZQ12 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NinlQ6ZQ12 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
NinlQ6ZQ12 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NinlQ6ZQ12 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
NinlQ6ZQ12 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NinlQ6ZQ12 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NinlQ6ZQ12 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NinlQ6ZQ12 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NinlQ6ZQ12 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NinlQ6ZQ12 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NinlQ6ZQ12 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NinlQ6ZQ12 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NinlQ6ZQ12 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NinlQ6ZQ12 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NinlQ6ZQ12 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NinlQ6ZQ12 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NinlQ6ZQ12 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NinlQ6ZQ12 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NinlQ6ZQ12 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NinlQ6ZQ12 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NinlQ6ZQ12 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NinlQ6ZQ12 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
NinlQ6ZQ12 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NinlQ6ZQ12 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NinlQ6ZQ12 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NinlQ6ZQ12 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NinlQ6ZQ12 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NinlQ6ZQ12 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NinlQ6ZQ12 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NinlQ6ZQ12 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NinlQ6ZQ12 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NinlQ6ZQ12 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NinlQ6ZQ12 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NinlQ6ZQ12 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NinlQ6ZQ12 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NinlQ6ZQ12 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NinlQ6ZQ12 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NinlQ6ZQ12 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NinlQ6ZQ12 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NinlQ6ZQ12 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NinlQ6ZQ12 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NinlQ6ZQ12 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NinlQ6ZQ12 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NinlQ6ZQ12 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NinlQ6ZQ12 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NinlQ6ZQ12 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NinlQ6ZQ12 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NinlQ6ZQ12 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NinlQ6ZQ12 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NinlQ6ZQ12 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NinlQ6ZQ12 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NinlQ6ZQ12 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NinlQ6ZQ12 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NinlQ6ZQ12 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NinlQ6ZQ12 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NinlQ6ZQ12 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NinlQ6ZQ12 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NinlQ6ZQ12 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NinlQ6ZQ12 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NinlQ6ZQ12 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NinlQ6ZQ12 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC21.27■■□□□ 1
NinlQ6ZQ12 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC21.27■■□□□ 1
NinlQ6ZQ12 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NinlQ6ZQ12 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NinlQ6ZQ12 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC21.27■■□□□ 1
NinlQ6ZQ12 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NinlQ6ZQ12 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NinlQ6ZQ12 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
NinlQ6ZQ12 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC21.27■■□□□ 1
NinlQ6ZQ12 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NinlQ6ZQ12 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NinlQ6ZQ12 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NinlQ6ZQ12 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NinlQ6ZQ12 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
NinlQ6ZQ12 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NinlQ6ZQ12 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NinlQ6ZQ12 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NinlQ6ZQ12 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NinlQ6ZQ12 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NinlQ6ZQ12 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NinlQ6ZQ12 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NinlQ6ZQ12 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NinlQ6ZQ12 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NinlQ6ZQ12 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NinlQ6ZQ12 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NinlQ6ZQ12 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
NinlQ6ZQ12 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NinlQ6ZQ12 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NinlQ6ZQ12 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NinlQ6ZQ12 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NinlQ6ZQ12 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NinlQ6ZQ12 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NinlQ6ZQ12 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
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