Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ08

Cnot1, CCR4-NOT transcription complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot1Q6ZQ08 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cnot1Q6ZQ08 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cnot1Q6ZQ08 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cnot1Q6ZQ08 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cnot1Q6ZQ08 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cnot1Q6ZQ08 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cnot1Q6ZQ08 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cnot1Q6ZQ08 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cnot1Q6ZQ08 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cnot1Q6ZQ08 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cnot1Q6ZQ08 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Cnot1Q6ZQ08 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cnot1Q6ZQ08 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Cnot1Q6ZQ08 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cnot1Q6ZQ08 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cnot1Q6ZQ08 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Cnot1Q6ZQ08 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cnot1Q6ZQ08 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cnot1Q6ZQ08 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cnot1Q6ZQ08 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cnot1Q6ZQ08 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cnot1Q6ZQ08 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cnot1Q6ZQ08 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cnot1Q6ZQ08 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cnot1Q6ZQ08 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cnot1Q6ZQ08 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cnot1Q6ZQ08 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cnot1Q6ZQ08 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cnot1Q6ZQ08 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cnot1Q6ZQ08 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cnot1Q6ZQ08 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cnot1Q6ZQ08 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cnot1Q6ZQ08 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cnot1Q6ZQ08 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cnot1Q6ZQ08 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cnot1Q6ZQ08 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Cnot1Q6ZQ08 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cnot1Q6ZQ08 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cnot1Q6ZQ08 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Cnot1Q6ZQ08 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cnot1Q6ZQ08 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cnot1Q6ZQ08 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cnot1Q6ZQ08 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cnot1Q6ZQ08 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cnot1Q6ZQ08 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cnot1Q6ZQ08 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cnot1Q6ZQ08 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cnot1Q6ZQ08 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cnot1Q6ZQ08 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cnot1Q6ZQ08 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cnot1Q6ZQ08 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cnot1Q6ZQ08 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cnot1Q6ZQ08 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cnot1Q6ZQ08 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cnot1Q6ZQ08 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cnot1Q6ZQ08 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cnot1Q6ZQ08 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cnot1Q6ZQ08 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Cnot1Q6ZQ08 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Cnot1Q6ZQ08 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cnot1Q6ZQ08 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cnot1Q6ZQ08 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cnot1Q6ZQ08 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cnot1Q6ZQ08 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cnot1Q6ZQ08 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cnot1Q6ZQ08 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cnot1Q6ZQ08 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cnot1Q6ZQ08 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cnot1Q6ZQ08 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cnot1Q6ZQ08 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cnot1Q6ZQ08 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cnot1Q6ZQ08 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cnot1Q6ZQ08 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cnot1Q6ZQ08 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cnot1Q6ZQ08 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cnot1Q6ZQ08 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cnot1Q6ZQ08 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cnot1Q6ZQ08 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cnot1Q6ZQ08 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cnot1Q6ZQ08 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cnot1Q6ZQ08 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cnot1Q6ZQ08 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cnot1Q6ZQ08 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnot1Q6ZQ08 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnot1Q6ZQ08 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnot1Q6ZQ08 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnot1Q6ZQ08 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnot1Q6ZQ08 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnot1Q6ZQ08 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnot1Q6ZQ08 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnot1Q6ZQ08 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnot1Q6ZQ08 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnot1Q6ZQ08 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnot1Q6ZQ08 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnot1Q6ZQ08 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnot1Q6ZQ08 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnot1Q6ZQ08 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnot1Q6ZQ08 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnot1Q6ZQ08 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnot1Q6ZQ08 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms