Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc88cQ6VGS5 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc88cQ6VGS5 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc88cQ6VGS5 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc88cQ6VGS5 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc88cQ6VGS5 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc88cQ6VGS5 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc88cQ6VGS5 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc88cQ6VGS5 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc88cQ6VGS5 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc88cQ6VGS5 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc88cQ6VGS5 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc88cQ6VGS5 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc88cQ6VGS5 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc88cQ6VGS5 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc88cQ6VGS5 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc88cQ6VGS5 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc88cQ6VGS5 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc88cQ6VGS5 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc88cQ6VGS5 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc88cQ6VGS5 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc88cQ6VGS5 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc88cQ6VGS5 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc88cQ6VGS5 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc88cQ6VGS5 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc88cQ6VGS5 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc88cQ6VGS5 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc88cQ6VGS5 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc88cQ6VGS5 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc88cQ6VGS5 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc88cQ6VGS5 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc88cQ6VGS5 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc88cQ6VGS5 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc88cQ6VGS5 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc88cQ6VGS5 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc88cQ6VGS5 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc88cQ6VGS5 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc88cQ6VGS5 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc88cQ6VGS5 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc88cQ6VGS5 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc88cQ6VGS5 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc88cQ6VGS5 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc88cQ6VGS5 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc88cQ6VGS5 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc88cQ6VGS5 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc88cQ6VGS5 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc88cQ6VGS5 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc88cQ6VGS5 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc88cQ6VGS5 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc88cQ6VGS5 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc88cQ6VGS5 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc88cQ6VGS5 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc88cQ6VGS5 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc88cQ6VGS5 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc88cQ6VGS5 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ccdc88cQ6VGS5 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc88cQ6VGS5 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc88cQ6VGS5 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc88cQ6VGS5 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms