Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDZ2

Taf1c, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1cQ6PDZ2 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Taf1cQ6PDZ2 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Taf1cQ6PDZ2 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Taf1cQ6PDZ2 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Taf1cQ6PDZ2 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Taf1cQ6PDZ2 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Taf1cQ6PDZ2 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Taf1cQ6PDZ2 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Taf1cQ6PDZ2 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Taf1cQ6PDZ2 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Taf1cQ6PDZ2 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Taf1cQ6PDZ2 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Taf1cQ6PDZ2 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Taf1cQ6PDZ2 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Taf1cQ6PDZ2 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Taf1cQ6PDZ2 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Taf1cQ6PDZ2 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Taf1cQ6PDZ2 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Taf1cQ6PDZ2 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Taf1cQ6PDZ2 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Taf1cQ6PDZ2 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Taf1cQ6PDZ2 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Taf1cQ6PDZ2 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Taf1cQ6PDZ2 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Taf1cQ6PDZ2 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Taf1cQ6PDZ2 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Taf1cQ6PDZ2 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Taf1cQ6PDZ2 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Taf1cQ6PDZ2 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Taf1cQ6PDZ2 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Taf1cQ6PDZ2 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Taf1cQ6PDZ2 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Taf1cQ6PDZ2 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Taf1cQ6PDZ2 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Taf1cQ6PDZ2 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Taf1cQ6PDZ2 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Taf1cQ6PDZ2 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Taf1cQ6PDZ2 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Taf1cQ6PDZ2 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Taf1cQ6PDZ2 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Taf1cQ6PDZ2 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Taf1cQ6PDZ2 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Taf1cQ6PDZ2 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Taf1cQ6PDZ2 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Taf1cQ6PDZ2 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Taf1cQ6PDZ2 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Taf1cQ6PDZ2 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Taf1cQ6PDZ2 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Taf1cQ6PDZ2 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Taf1cQ6PDZ2 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Taf1cQ6PDZ2 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Taf1cQ6PDZ2 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Taf1cQ6PDZ2 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Taf1cQ6PDZ2 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Taf1cQ6PDZ2 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Taf1cQ6PDZ2 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Taf1cQ6PDZ2 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Taf1cQ6PDZ2 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Taf1cQ6PDZ2 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Taf1cQ6PDZ2 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Taf1cQ6PDZ2 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Taf1cQ6PDZ2 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Taf1cQ6PDZ2 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Taf1cQ6PDZ2 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Taf1cQ6PDZ2 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Taf1cQ6PDZ2 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Taf1cQ6PDZ2 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Taf1cQ6PDZ2 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Taf1cQ6PDZ2 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Taf1cQ6PDZ2 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Taf1cQ6PDZ2 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Taf1cQ6PDZ2 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Taf1cQ6PDZ2 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Taf1cQ6PDZ2 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Taf1cQ6PDZ2 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Taf1cQ6PDZ2 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Taf1cQ6PDZ2 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Taf1cQ6PDZ2 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Taf1cQ6PDZ2 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Taf1cQ6PDZ2 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Taf1cQ6PDZ2 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Taf1cQ6PDZ2 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Taf1cQ6PDZ2 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Taf1cQ6PDZ2 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Taf1cQ6PDZ2 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Taf1cQ6PDZ2 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Taf1cQ6PDZ2 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Taf1cQ6PDZ2 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Taf1cQ6PDZ2 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Taf1cQ6PDZ2 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Taf1cQ6PDZ2 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Taf1cQ6PDZ2 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Taf1cQ6PDZ2 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Taf1cQ6PDZ2 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Taf1cQ6PDZ2 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Taf1cQ6PDZ2 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Taf1cQ6PDZ2 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Taf1cQ6PDZ2 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Taf1cQ6PDZ2 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Taf1cQ6PDZ2 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.4 ms