Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXH3

Gpbp1, Vasculin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1Q6NXH3 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gpbp1Q6NXH3 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gpbp1Q6NXH3 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gpbp1Q6NXH3 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gpbp1Q6NXH3 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Gpbp1Q6NXH3 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Gpbp1Q6NXH3 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Gpbp1Q6NXH3 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gpbp1Q6NXH3 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gpbp1Q6NXH3 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gpbp1Q6NXH3 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gpbp1Q6NXH3 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gpbp1Q6NXH3 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gpbp1Q6NXH3 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gpbp1Q6NXH3 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gpbp1Q6NXH3 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gpbp1Q6NXH3 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gpbp1Q6NXH3 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gpbp1Q6NXH3 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gpbp1Q6NXH3 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gpbp1Q6NXH3 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gpbp1Q6NXH3 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gpbp1Q6NXH3 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gpbp1Q6NXH3 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gpbp1Q6NXH3 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gpbp1Q6NXH3 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gpbp1Q6NXH3 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gpbp1Q6NXH3 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gpbp1Q6NXH3 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gpbp1Q6NXH3 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gpbp1Q6NXH3 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gpbp1Q6NXH3 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gpbp1Q6NXH3 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gpbp1Q6NXH3 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gpbp1Q6NXH3 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gpbp1Q6NXH3 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gpbp1Q6NXH3 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gpbp1Q6NXH3 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gpbp1Q6NXH3 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gpbp1Q6NXH3 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gpbp1Q6NXH3 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gpbp1Q6NXH3 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gpbp1Q6NXH3 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gpbp1Q6NXH3 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gpbp1Q6NXH3 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gpbp1Q6NXH3 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gpbp1Q6NXH3 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gpbp1Q6NXH3 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gpbp1Q6NXH3 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gpbp1Q6NXH3 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gpbp1Q6NXH3 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Gpbp1Q6NXH3 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gpbp1Q6NXH3 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gpbp1Q6NXH3 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gpbp1Q6NXH3 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gpbp1Q6NXH3 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gpbp1Q6NXH3 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gpbp1Q6NXH3 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gpbp1Q6NXH3 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gpbp1Q6NXH3 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gpbp1Q6NXH3 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gpbp1Q6NXH3 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gpbp1Q6NXH3 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gpbp1Q6NXH3 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gpbp1Q6NXH3 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gpbp1Q6NXH3 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gpbp1Q6NXH3 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gpbp1Q6NXH3 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gpbp1Q6NXH3 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gpbp1Q6NXH3 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gpbp1Q6NXH3 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gpbp1Q6NXH3 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gpbp1Q6NXH3 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gpbp1Q6NXH3 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gpbp1Q6NXH3 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Gpbp1Q6NXH3 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Gpbp1Q6NXH3 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gpbp1Q6NXH3 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Gpbp1Q6NXH3 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Gpbp1Q6NXH3 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gpbp1Q6NXH3 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gpbp1Q6NXH3 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gpbp1Q6NXH3 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gpbp1Q6NXH3 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gpbp1Q6NXH3 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gpbp1Q6NXH3 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gpbp1Q6NXH3 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gpbp1Q6NXH3 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gpbp1Q6NXH3 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gpbp1Q6NXH3 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gpbp1Q6NXH3 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gpbp1Q6NXH3 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gpbp1Q6NXH3 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Gpbp1Q6NXH3 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gpbp1Q6NXH3 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gpbp1Q6NXH3 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gpbp1Q6NXH3 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gpbp1Q6NXH3 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Gpbp1Q6NXH3 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gpbp1Q6NXH3 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms