Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS45

Ccdc66, Coiled-coil domain-containing protein 66, mousemouse

Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc66Q6NS45 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc66Q6NS45 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc66Q6NS45 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc66Q6NS45 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc66Q6NS45 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc66Q6NS45 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc66Q6NS45 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc66Q6NS45 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc66Q6NS45 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc66Q6NS45 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc66Q6NS45 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc66Q6NS45 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc66Q6NS45 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc66Q6NS45 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc66Q6NS45 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc66Q6NS45 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc66Q6NS45 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc66Q6NS45 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc66Q6NS45 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc66Q6NS45 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc66Q6NS45 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc66Q6NS45 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc66Q6NS45 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc66Q6NS45 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc66Q6NS45 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc66Q6NS45 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc66Q6NS45 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc66Q6NS45 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc66Q6NS45 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc66Q6NS45 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc66Q6NS45 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc66Q6NS45 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc66Q6NS45 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc66Q6NS45 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc66Q6NS45 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc66Q6NS45 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc66Q6NS45 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc66Q6NS45 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc66Q6NS45 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc66Q6NS45 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc66Q6NS45 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc66Q6NS45 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc66Q6NS45 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc66Q6NS45 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc66Q6NS45 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc66Q6NS45 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc66Q6NS45 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc66Q6NS45 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc66Q6NS45 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc66Q6NS45 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc66Q6NS45 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc66Q6NS45 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc66Q6NS45 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc66Q6NS45 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc66Q6NS45 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc66Q6NS45 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc66Q6NS45 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc66Q6NS45 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc66Q6NS45 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc66Q6NS45 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc66Q6NS45 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc66Q6NS45 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc66Q6NS45 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc66Q6NS45 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc66Q6NS45 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc66Q6NS45 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc66Q6NS45 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc66Q6NS45 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc66Q6NS45 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc66Q6NS45 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc66Q6NS45 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc66Q6NS45 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc66Q6NS45 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc66Q6NS45 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc66Q6NS45 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc66Q6NS45 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc66Q6NS45 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc66Q6NS45 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc66Q6NS45 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc66Q6NS45 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc66Q6NS45 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc66Q6NS45 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc66Q6NS45 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc66Q6NS45 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc66Q6NS45 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc66Q6NS45 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc66Q6NS45 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc66Q6NS45 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc66Q6NS45 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc66Q6NS45 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc66Q6NS45 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc66Q6NS45 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc66Q6NS45 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc66Q6NS45 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc66Q6NS45 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc66Q6NS45 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc66Q6NS45 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc66Q6NS45 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc66Q6NS45 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc66Q6NS45 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms