Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ19

CCSAP, Centriole, cilia and spindle-associated protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAPQ6IQ19 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CCSAPQ6IQ19 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCSAPQ6IQ19 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCSAPQ6IQ19 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCSAPQ6IQ19 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCSAPQ6IQ19 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCSAPQ6IQ19 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCSAPQ6IQ19 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCSAPQ6IQ19 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCSAPQ6IQ19 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCSAPQ6IQ19 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCSAPQ6IQ19 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
CCSAPQ6IQ19 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCSAPQ6IQ19 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCSAPQ6IQ19 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCSAPQ6IQ19 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCSAPQ6IQ19 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCSAPQ6IQ19 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCSAPQ6IQ19 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCSAPQ6IQ19 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCSAPQ6IQ19 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCSAPQ6IQ19 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCSAPQ6IQ19 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCSAPQ6IQ19 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCSAPQ6IQ19 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCSAPQ6IQ19 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCSAPQ6IQ19 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCSAPQ6IQ19 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CCSAPQ6IQ19 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCSAPQ6IQ19 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCSAPQ6IQ19 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCSAPQ6IQ19 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCSAPQ6IQ19 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCSAPQ6IQ19 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CCSAPQ6IQ19 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCSAPQ6IQ19 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCSAPQ6IQ19 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCSAPQ6IQ19 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCSAPQ6IQ19 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCSAPQ6IQ19 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCSAPQ6IQ19 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCSAPQ6IQ19 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCSAPQ6IQ19 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCSAPQ6IQ19 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCSAPQ6IQ19 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCSAPQ6IQ19 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCSAPQ6IQ19 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CCSAPQ6IQ19 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCSAPQ6IQ19 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCSAPQ6IQ19 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CCSAPQ6IQ19 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCSAPQ6IQ19 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCSAPQ6IQ19 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCSAPQ6IQ19 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCSAPQ6IQ19 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCSAPQ6IQ19 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCSAPQ6IQ19 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCSAPQ6IQ19 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCSAPQ6IQ19 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCSAPQ6IQ19 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCSAPQ6IQ19 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCSAPQ6IQ19 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCSAPQ6IQ19 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCSAPQ6IQ19 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCSAPQ6IQ19 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCSAPQ6IQ19 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCSAPQ6IQ19 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCSAPQ6IQ19 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCSAPQ6IQ19 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCSAPQ6IQ19 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CCSAPQ6IQ19 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCSAPQ6IQ19 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCSAPQ6IQ19 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCSAPQ6IQ19 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CCSAPQ6IQ19 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CCSAPQ6IQ19 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCSAPQ6IQ19 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCSAPQ6IQ19 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCSAPQ6IQ19 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCSAPQ6IQ19 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCSAPQ6IQ19 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCSAPQ6IQ19 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCSAPQ6IQ19 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCSAPQ6IQ19 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCSAPQ6IQ19 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CCSAPQ6IQ19 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCSAPQ6IQ19 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCSAPQ6IQ19 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCSAPQ6IQ19 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCSAPQ6IQ19 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCSAPQ6IQ19 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCSAPQ6IQ19 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCSAPQ6IQ19 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCSAPQ6IQ19 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CCSAPQ6IQ19 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCSAPQ6IQ19 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCSAPQ6IQ19 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCSAPQ6IQ19 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCSAPQ6IQ19 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCSAPQ6IQ19 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms