Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX4

Krt39, Keratin, type I cytoskeletal 39, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt39Q6IFX4 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Krt39Q6IFX4 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Krt39Q6IFX4 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Krt39Q6IFX4 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Krt39Q6IFX4 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Krt39Q6IFX4 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Krt39Q6IFX4 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Krt39Q6IFX4 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Krt39Q6IFX4 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Krt39Q6IFX4 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Krt39Q6IFX4 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Krt39Q6IFX4 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Krt39Q6IFX4 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Krt39Q6IFX4 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Krt39Q6IFX4 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Krt39Q6IFX4 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Krt39Q6IFX4 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Krt39Q6IFX4 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Krt39Q6IFX4 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Krt39Q6IFX4 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Krt39Q6IFX4 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Krt39Q6IFX4 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Krt39Q6IFX4 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Krt39Q6IFX4 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Krt39Q6IFX4 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Krt39Q6IFX4 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Krt39Q6IFX4 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Krt39Q6IFX4 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Krt39Q6IFX4 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Krt39Q6IFX4 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Krt39Q6IFX4 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Krt39Q6IFX4 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Krt39Q6IFX4 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Krt39Q6IFX4 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Krt39Q6IFX4 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Krt39Q6IFX4 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Krt39Q6IFX4 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Krt39Q6IFX4 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Krt39Q6IFX4 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Krt39Q6IFX4 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Krt39Q6IFX4 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Krt39Q6IFX4 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Krt39Q6IFX4 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Krt39Q6IFX4 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Krt39Q6IFX4 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Krt39Q6IFX4 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Krt39Q6IFX4 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Krt39Q6IFX4 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Krt39Q6IFX4 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Krt39Q6IFX4 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Krt39Q6IFX4 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Krt39Q6IFX4 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Krt39Q6IFX4 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Krt39Q6IFX4 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Krt39Q6IFX4 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Krt39Q6IFX4 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Krt39Q6IFX4 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Krt39Q6IFX4 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Krt39Q6IFX4 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Krt39Q6IFX4 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Krt39Q6IFX4 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Krt39Q6IFX4 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Krt39Q6IFX4 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Krt39Q6IFX4 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Krt39Q6IFX4 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Krt39Q6IFX4 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Krt39Q6IFX4 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Krt39Q6IFX4 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Krt39Q6IFX4 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Krt39Q6IFX4 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Krt39Q6IFX4 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Krt39Q6IFX4 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Krt39Q6IFX4 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Krt39Q6IFX4 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Krt39Q6IFX4 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Krt39Q6IFX4 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Krt39Q6IFX4 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Krt39Q6IFX4 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Krt39Q6IFX4 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Krt39Q6IFX4 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Krt39Q6IFX4 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Krt39Q6IFX4 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Krt39Q6IFX4 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Krt39Q6IFX4 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Krt39Q6IFX4 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Krt39Q6IFX4 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Krt39Q6IFX4 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Krt39Q6IFX4 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Krt39Q6IFX4 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Krt39Q6IFX4 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Krt39Q6IFX4 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Krt39Q6IFX4 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Krt39Q6IFX4 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Krt39Q6IFX4 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Krt39Q6IFX4 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Krt39Q6IFX4 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Krt39Q6IFX4 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Krt39Q6IFX4 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Krt39Q6IFX4 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Krt39Q6IFX4 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms