Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Smarca2Q6DIC0 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Smarca2Q6DIC0 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Smarca2Q6DIC0 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Smarca2Q6DIC0 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Smarca2Q6DIC0 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Smarca2Q6DIC0 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Smarca2Q6DIC0 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Smarca2Q6DIC0 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Smarca2Q6DIC0 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Smarca2Q6DIC0 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Smarca2Q6DIC0 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Smarca2Q6DIC0 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Smarca2Q6DIC0 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Smarca2Q6DIC0 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Smarca2Q6DIC0 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Smarca2Q6DIC0 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Smarca2Q6DIC0 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Smarca2Q6DIC0 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Smarca2Q6DIC0 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Smarca2Q6DIC0 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Smarca2Q6DIC0 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Smarca2Q6DIC0 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Smarca2Q6DIC0 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Smarca2Q6DIC0 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Smarca2Q6DIC0 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Smarca2Q6DIC0 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Smarca2Q6DIC0 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Smarca2Q6DIC0 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Smarca2Q6DIC0 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Smarca2Q6DIC0 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Smarca2Q6DIC0 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Smarca2Q6DIC0 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Smarca2Q6DIC0 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Smarca2Q6DIC0 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Smarca2Q6DIC0 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Smarca2Q6DIC0 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Smarca2Q6DIC0 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Smarca2Q6DIC0 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Smarca2Q6DIC0 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Smarca2Q6DIC0 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Smarca2Q6DIC0 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Smarca2Q6DIC0 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Smarca2Q6DIC0 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Smarca2Q6DIC0 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Smarca2Q6DIC0 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Smarca2Q6DIC0 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Smarca2Q6DIC0 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Smarca2Q6DIC0 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Smarca2Q6DIC0 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Smarca2Q6DIC0 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Smarca2Q6DIC0 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Smarca2Q6DIC0 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Smarca2Q6DIC0 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Smarca2Q6DIC0 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Smarca2Q6DIC0 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Smarca2Q6DIC0 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Smarca2Q6DIC0 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Smarca2Q6DIC0 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Smarca2Q6DIC0 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Smarca2Q6DIC0 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Smarca2Q6DIC0 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Smarca2Q6DIC0 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Smarca2Q6DIC0 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Smarca2Q6DIC0 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Smarca2Q6DIC0 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Smarca2Q6DIC0 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Smarca2Q6DIC0 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Smarca2Q6DIC0 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Smarca2Q6DIC0 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Smarca2Q6DIC0 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Smarca2Q6DIC0 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Smarca2Q6DIC0 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Smarca2Q6DIC0 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Smarca2Q6DIC0 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Smarca2Q6DIC0 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Smarca2Q6DIC0 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Smarca2Q6DIC0 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Smarca2Q6DIC0 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Smarca2Q6DIC0 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Smarca2Q6DIC0 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Smarca2Q6DIC0 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Smarca2Q6DIC0 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Smarca2Q6DIC0 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Smarca2Q6DIC0 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Smarca2Q6DIC0 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Smarca2Q6DIC0 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Smarca2Q6DIC0 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Smarca2Q6DIC0 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Smarca2Q6DIC0 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Smarca2Q6DIC0 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Smarca2Q6DIC0 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Smarca2Q6DIC0 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Smarca2Q6DIC0 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Smarca2Q6DIC0 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Smarca2Q6DIC0 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Smarca2Q6DIC0 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Smarca2Q6DIC0 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Smarca2Q6DIC0 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Smarca2Q6DIC0 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms