Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nop58Q6DFW4 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nop58Q6DFW4 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nop58Q6DFW4 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nop58Q6DFW4 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nop58Q6DFW4 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nop58Q6DFW4 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nop58Q6DFW4 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nop58Q6DFW4 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nop58Q6DFW4 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nop58Q6DFW4 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nop58Q6DFW4 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nop58Q6DFW4 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nop58Q6DFW4 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nop58Q6DFW4 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nop58Q6DFW4 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nop58Q6DFW4 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nop58Q6DFW4 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nop58Q6DFW4 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nop58Q6DFW4 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nop58Q6DFW4 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nop58Q6DFW4 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nop58Q6DFW4 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nop58Q6DFW4 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Nop58Q6DFW4 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nop58Q6DFW4 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nop58Q6DFW4 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nop58Q6DFW4 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nop58Q6DFW4 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nop58Q6DFW4 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nop58Q6DFW4 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nop58Q6DFW4 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nop58Q6DFW4 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nop58Q6DFW4 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nop58Q6DFW4 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Nop58Q6DFW4 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nop58Q6DFW4 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nop58Q6DFW4 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nop58Q6DFW4 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nop58Q6DFW4 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nop58Q6DFW4 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nop58Q6DFW4 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Nop58Q6DFW4 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nop58Q6DFW4 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nop58Q6DFW4 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nop58Q6DFW4 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nop58Q6DFW4 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nop58Q6DFW4 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nop58Q6DFW4 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nop58Q6DFW4 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nop58Q6DFW4 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nop58Q6DFW4 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nop58Q6DFW4 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Nop58Q6DFW4 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Nop58Q6DFW4 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nop58Q6DFW4 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nop58Q6DFW4 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nop58Q6DFW4 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nop58Q6DFW4 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Nop58Q6DFW4 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nop58Q6DFW4 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nop58Q6DFW4 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nop58Q6DFW4 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nop58Q6DFW4 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nop58Q6DFW4 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nop58Q6DFW4 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nop58Q6DFW4 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nop58Q6DFW4 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nop58Q6DFW4 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nop58Q6DFW4 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nop58Q6DFW4 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Nop58Q6DFW4 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nop58Q6DFW4 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nop58Q6DFW4 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nop58Q6DFW4 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nop58Q6DFW4 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nop58Q6DFW4 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Nop58Q6DFW4 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nop58Q6DFW4 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nop58Q6DFW4 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nop58Q6DFW4 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nop58Q6DFW4 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nop58Q6DFW4 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nop58Q6DFW4 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nop58Q6DFW4 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nop58Q6DFW4 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nop58Q6DFW4 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nop58Q6DFW4 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nop58Q6DFW4 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nop58Q6DFW4 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nop58Q6DFW4 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nop58Q6DFW4 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nop58Q6DFW4 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nop58Q6DFW4 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nop58Q6DFW4 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nop58Q6DFW4 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nop58Q6DFW4 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nop58Q6DFW4 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nop58Q6DFW4 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nop58Q6DFW4 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms