Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZI1

Sh3rf1, E3 ubiquitin-protein ligase SH3RF1, mousemouse

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Length 892 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3rf1Q69ZI1 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Sh3rf1Q69ZI1 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sh3rf1Q69ZI1 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sh3rf1Q69ZI1 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sh3rf1Q69ZI1 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Sh3rf1Q69ZI1 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh3rf1Q69ZI1 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Sh3rf1Q69ZI1 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Sh3rf1Q69ZI1 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh3rf1Q69ZI1 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Sh3rf1Q69ZI1 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Sh3rf1Q69ZI1 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Sh3rf1Q69ZI1 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh3rf1Q69ZI1 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh3rf1Q69ZI1 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh3rf1Q69ZI1 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh3rf1Q69ZI1 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sh3rf1Q69ZI1 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sh3rf1Q69ZI1 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Sh3rf1Q69ZI1 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sh3rf1Q69ZI1 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Sh3rf1Q69ZI1 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
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