Protein–RNA interactions for Protein: Q69Z26

Cntn4, Contactin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn4Q69Z26 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cntn4Q69Z26 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cntn4Q69Z26 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cntn4Q69Z26 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cntn4Q69Z26 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cntn4Q69Z26 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cntn4Q69Z26 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cntn4Q69Z26 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cntn4Q69Z26 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cntn4Q69Z26 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cntn4Q69Z26 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cntn4Q69Z26 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cntn4Q69Z26 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cntn4Q69Z26 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cntn4Q69Z26 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cntn4Q69Z26 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cntn4Q69Z26 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cntn4Q69Z26 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cntn4Q69Z26 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cntn4Q69Z26 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cntn4Q69Z26 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cntn4Q69Z26 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cntn4Q69Z26 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cntn4Q69Z26 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cntn4Q69Z26 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cntn4Q69Z26 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cntn4Q69Z26 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cntn4Q69Z26 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cntn4Q69Z26 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cntn4Q69Z26 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cntn4Q69Z26 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cntn4Q69Z26 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cntn4Q69Z26 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cntn4Q69Z26 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cntn4Q69Z26 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cntn4Q69Z26 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cntn4Q69Z26 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cntn4Q69Z26 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cntn4Q69Z26 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cntn4Q69Z26 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cntn4Q69Z26 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cntn4Q69Z26 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cntn4Q69Z26 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cntn4Q69Z26 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cntn4Q69Z26 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cntn4Q69Z26 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cntn4Q69Z26 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cntn4Q69Z26 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cntn4Q69Z26 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cntn4Q69Z26 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cntn4Q69Z26 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cntn4Q69Z26 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cntn4Q69Z26 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cntn4Q69Z26 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cntn4Q69Z26 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cntn4Q69Z26 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cntn4Q69Z26 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cntn4Q69Z26 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cntn4Q69Z26 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cntn4Q69Z26 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cntn4Q69Z26 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cntn4Q69Z26 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cntn4Q69Z26 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cntn4Q69Z26 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cntn4Q69Z26 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cntn4Q69Z26 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cntn4Q69Z26 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cntn4Q69Z26 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cntn4Q69Z26 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cntn4Q69Z26 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cntn4Q69Z26 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cntn4Q69Z26 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cntn4Q69Z26 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cntn4Q69Z26 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cntn4Q69Z26 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cntn4Q69Z26 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cntn4Q69Z26 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cntn4Q69Z26 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cntn4Q69Z26 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cntn4Q69Z26 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cntn4Q69Z26 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cntn4Q69Z26 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cntn4Q69Z26 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cntn4Q69Z26 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cntn4Q69Z26 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cntn4Q69Z26 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cntn4Q69Z26 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cntn4Q69Z26 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cntn4Q69Z26 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cntn4Q69Z26 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cntn4Q69Z26 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cntn4Q69Z26 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cntn4Q69Z26 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cntn4Q69Z26 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cntn4Q69Z26 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cntn4Q69Z26 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cntn4Q69Z26 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cntn4Q69Z26 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cntn4Q69Z26 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cntn4Q69Z26 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms