Protein–RNA interactions for Protein: Q66JQ7

Knl1, Kinetochore scaffold 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knl1Q66JQ7 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Knl1Q66JQ7 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Knl1Q66JQ7 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Knl1Q66JQ7 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Knl1Q66JQ7 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Knl1Q66JQ7 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Knl1Q66JQ7 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Knl1Q66JQ7 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Knl1Q66JQ7 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Knl1Q66JQ7 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Knl1Q66JQ7 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Knl1Q66JQ7 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Knl1Q66JQ7 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Knl1Q66JQ7 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Knl1Q66JQ7 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Knl1Q66JQ7 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Knl1Q66JQ7 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Knl1Q66JQ7 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Knl1Q66JQ7 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Knl1Q66JQ7 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Knl1Q66JQ7 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Knl1Q66JQ7 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Knl1Q66JQ7 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Knl1Q66JQ7 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Knl1Q66JQ7 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Knl1Q66JQ7 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Knl1Q66JQ7 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Knl1Q66JQ7 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Knl1Q66JQ7 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Knl1Q66JQ7 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Knl1Q66JQ7 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Knl1Q66JQ7 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Knl1Q66JQ7 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Knl1Q66JQ7 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Knl1Q66JQ7 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Knl1Q66JQ7 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Knl1Q66JQ7 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Knl1Q66JQ7 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Knl1Q66JQ7 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Knl1Q66JQ7 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Knl1Q66JQ7 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Knl1Q66JQ7 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Knl1Q66JQ7 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Knl1Q66JQ7 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Knl1Q66JQ7 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Knl1Q66JQ7 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Knl1Q66JQ7 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Knl1Q66JQ7 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Knl1Q66JQ7 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Knl1Q66JQ7 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Knl1Q66JQ7 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Knl1Q66JQ7 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Knl1Q66JQ7 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Knl1Q66JQ7 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Knl1Q66JQ7 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Knl1Q66JQ7 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Knl1Q66JQ7 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Knl1Q66JQ7 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Knl1Q66JQ7 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Knl1Q66JQ7 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Knl1Q66JQ7 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Knl1Q66JQ7 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Knl1Q66JQ7 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Knl1Q66JQ7 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Knl1Q66JQ7 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Knl1Q66JQ7 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Knl1Q66JQ7 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Knl1Q66JQ7 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Knl1Q66JQ7 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Knl1Q66JQ7 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Knl1Q66JQ7 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Knl1Q66JQ7 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Knl1Q66JQ7 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Knl1Q66JQ7 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Knl1Q66JQ7 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Knl1Q66JQ7 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Knl1Q66JQ7 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Knl1Q66JQ7 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Knl1Q66JQ7 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Knl1Q66JQ7 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Knl1Q66JQ7 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Knl1Q66JQ7 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Knl1Q66JQ7 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Knl1Q66JQ7 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Knl1Q66JQ7 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Knl1Q66JQ7 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Knl1Q66JQ7 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Knl1Q66JQ7 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Knl1Q66JQ7 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Knl1Q66JQ7 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Knl1Q66JQ7 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Knl1Q66JQ7 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Knl1Q66JQ7 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Knl1Q66JQ7 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Knl1Q66JQ7 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Knl1Q66JQ7 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Knl1Q66JQ7 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Knl1Q66JQ7 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Knl1Q66JQ7 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Knl1Q66JQ7 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms