Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW7

Patj, InaD-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PatjQ63ZW7 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PatjQ63ZW7 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PatjQ63ZW7 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PatjQ63ZW7 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PatjQ63ZW7 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PatjQ63ZW7 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PatjQ63ZW7 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PatjQ63ZW7 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PatjQ63ZW7 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PatjQ63ZW7 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PatjQ63ZW7 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PatjQ63ZW7 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PatjQ63ZW7 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PatjQ63ZW7 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PatjQ63ZW7 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PatjQ63ZW7 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PatjQ63ZW7 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PatjQ63ZW7 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PatjQ63ZW7 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PatjQ63ZW7 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PatjQ63ZW7 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PatjQ63ZW7 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PatjQ63ZW7 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PatjQ63ZW7 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PatjQ63ZW7 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PatjQ63ZW7 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PatjQ63ZW7 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PatjQ63ZW7 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PatjQ63ZW7 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PatjQ63ZW7 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PatjQ63ZW7 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PatjQ63ZW7 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PatjQ63ZW7 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PatjQ63ZW7 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PatjQ63ZW7 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PatjQ63ZW7 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PatjQ63ZW7 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PatjQ63ZW7 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PatjQ63ZW7 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PatjQ63ZW7 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PatjQ63ZW7 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PatjQ63ZW7 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PatjQ63ZW7 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PatjQ63ZW7 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PatjQ63ZW7 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PatjQ63ZW7 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PatjQ63ZW7 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PatjQ63ZW7 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PatjQ63ZW7 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PatjQ63ZW7 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PatjQ63ZW7 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
PatjQ63ZW7 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PatjQ63ZW7 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PatjQ63ZW7 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PatjQ63ZW7 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PatjQ63ZW7 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PatjQ63ZW7 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PatjQ63ZW7 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PatjQ63ZW7 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PatjQ63ZW7 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PatjQ63ZW7 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PatjQ63ZW7 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PatjQ63ZW7 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PatjQ63ZW7 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PatjQ63ZW7 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PatjQ63ZW7 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PatjQ63ZW7 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PatjQ63ZW7 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PatjQ63ZW7 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PatjQ63ZW7 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PatjQ63ZW7 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PatjQ63ZW7 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PatjQ63ZW7 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PatjQ63ZW7 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PatjQ63ZW7 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PatjQ63ZW7 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PatjQ63ZW7 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PatjQ63ZW7 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PatjQ63ZW7 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PatjQ63ZW7 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PatjQ63ZW7 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PatjQ63ZW7 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PatjQ63ZW7 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PatjQ63ZW7 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PatjQ63ZW7 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PatjQ63ZW7 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PatjQ63ZW7 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PatjQ63ZW7 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PatjQ63ZW7 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PatjQ63ZW7 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PatjQ63ZW7 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PatjQ63ZW7 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PatjQ63ZW7 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PatjQ63ZW7 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PatjQ63ZW7 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PatjQ63ZW7 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PatjQ63ZW7 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PatjQ63ZW7 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PatjQ63ZW7 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PatjQ63ZW7 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms