Protein–RNA interactions for Protein: Q63871

Polr2k, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4, mousemouse

Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2kQ63871 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Polr2kQ63871 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Polr2kQ63871 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Polr2kQ63871 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Polr2kQ63871 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Polr2kQ63871 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Polr2kQ63871 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Polr2kQ63871 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Polr2kQ63871 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Polr2kQ63871 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Polr2kQ63871 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Polr2kQ63871 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Polr2kQ63871 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Polr2kQ63871 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Polr2kQ63871 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Polr2kQ63871 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Polr2kQ63871 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Polr2kQ63871 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Polr2kQ63871 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Polr2kQ63871 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Polr2kQ63871 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Polr2kQ63871 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Polr2kQ63871 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Polr2kQ63871 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Polr2kQ63871 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Polr2kQ63871 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Polr2kQ63871 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Polr2kQ63871 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Polr2kQ63871 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Polr2kQ63871 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Polr2kQ63871 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Polr2kQ63871 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Polr2kQ63871 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Polr2kQ63871 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Polr2kQ63871 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Polr2kQ63871 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Polr2kQ63871 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Polr2kQ63871 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Polr2kQ63871 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Polr2kQ63871 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Polr2kQ63871 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Polr2kQ63871 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Polr2kQ63871 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Polr2kQ63871 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Polr2kQ63871 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Polr2kQ63871 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Polr2kQ63871 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Polr2kQ63871 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Polr2kQ63871 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Polr2kQ63871 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Polr2kQ63871 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Polr2kQ63871 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Polr2kQ63871 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Polr2kQ63871 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Polr2kQ63871 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Polr2kQ63871 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Polr2kQ63871 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Polr2kQ63871 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Polr2kQ63871 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Polr2kQ63871 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Polr2kQ63871 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Polr2kQ63871 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Polr2kQ63871 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Polr2kQ63871 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Polr2kQ63871 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Polr2kQ63871 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Polr2kQ63871 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Polr2kQ63871 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Polr2kQ63871 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Polr2kQ63871 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Polr2kQ63871 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Polr2kQ63871 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Polr2kQ63871 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Polr2kQ63871 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Polr2kQ63871 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Polr2kQ63871 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Polr2kQ63871 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Polr2kQ63871 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Polr2kQ63871 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Polr2kQ63871 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Polr2kQ63871 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Polr2kQ63871 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Polr2kQ63871 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Polr2kQ63871 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Polr2kQ63871 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Polr2kQ63871 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Polr2kQ63871 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Polr2kQ63871 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Polr2kQ63871 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Polr2kQ63871 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Polr2kQ63871 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Polr2kQ63871 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Polr2kQ63871 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Polr2kQ63871 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Polr2kQ63871 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Polr2kQ63871 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Polr2kQ63871 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Polr2kQ63871 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Polr2kQ63871 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Polr2kQ63871 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms