Protein–RNA interactions for Protein: Q62445

Sp4, Transcription factor Sp4, mousemouse

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp4Q62445 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sp4Q62445 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sp4Q62445 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sp4Q62445 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sp4Q62445 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sp4Q62445 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sp4Q62445 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sp4Q62445 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sp4Q62445 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sp4Q62445 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sp4Q62445 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Sp4Q62445 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sp4Q62445 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sp4Q62445 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sp4Q62445 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Sp4Q62445 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Sp4Q62445 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Sp4Q62445 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sp4Q62445 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sp4Q62445 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sp4Q62445 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Sp4Q62445 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sp4Q62445 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sp4Q62445 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sp4Q62445 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sp4Q62445 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sp4Q62445 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sp4Q62445 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Sp4Q62445 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sp4Q62445 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sp4Q62445 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sp4Q62445 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sp4Q62445 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sp4Q62445 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sp4Q62445 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sp4Q62445 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sp4Q62445 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Sp4Q62445 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sp4Q62445 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sp4Q62445 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sp4Q62445 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sp4Q62445 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sp4Q62445 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Sp4Q62445 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sp4Q62445 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sp4Q62445 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sp4Q62445 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sp4Q62445 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sp4Q62445 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sp4Q62445 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sp4Q62445 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sp4Q62445 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sp4Q62445 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sp4Q62445 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sp4Q62445 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sp4Q62445 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sp4Q62445 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sp4Q62445 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sp4Q62445 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Sp4Q62445 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sp4Q62445 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sp4Q62445 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sp4Q62445 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sp4Q62445 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sp4Q62445 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Sp4Q62445 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sp4Q62445 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sp4Q62445 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sp4Q62445 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sp4Q62445 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sp4Q62445 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sp4Q62445 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Sp4Q62445 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sp4Q62445 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sp4Q62445 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sp4Q62445 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sp4Q62445 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Sp4Q62445 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sp4Q62445 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sp4Q62445 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sp4Q62445 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sp4Q62445 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sp4Q62445 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sp4Q62445 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sp4Q62445 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sp4Q62445 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sp4Q62445 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sp4Q62445 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sp4Q62445 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Sp4Q62445 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sp4Q62445 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sp4Q62445 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sp4Q62445 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sp4Q62445 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sp4Q62445 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sp4Q62445 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sp4Q62445 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sp4Q62445 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sp4Q62445 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sp4Q62445 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms