Protein–RNA interactions for Protein: Q62280

Ss18, Protein SSXT, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18Q62280 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ss18Q62280 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ss18Q62280 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ss18Q62280 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ss18Q62280 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ss18Q62280 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ss18Q62280 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ss18Q62280 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ss18Q62280 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ss18Q62280 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ss18Q62280 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ss18Q62280 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ss18Q62280 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ss18Q62280 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ss18Q62280 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ss18Q62280 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ss18Q62280 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ss18Q62280 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ss18Q62280 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ss18Q62280 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ss18Q62280 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ss18Q62280 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ss18Q62280 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ss18Q62280 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ss18Q62280 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ss18Q62280 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ss18Q62280 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ss18Q62280 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ss18Q62280 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ss18Q62280 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ss18Q62280 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ss18Q62280 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ss18Q62280 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ss18Q62280 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ss18Q62280 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ss18Q62280 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ss18Q62280 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ss18Q62280 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ss18Q62280 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ss18Q62280 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ss18Q62280 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ss18Q62280 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ss18Q62280 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ss18Q62280 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ss18Q62280 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ss18Q62280 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ss18Q62280 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ss18Q62280 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ss18Q62280 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ss18Q62280 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ss18Q62280 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ss18Q62280 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ss18Q62280 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ss18Q62280 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ss18Q62280 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ss18Q62280 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ss18Q62280 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ss18Q62280 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ss18Q62280 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ss18Q62280 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ss18Q62280 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ss18Q62280 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ss18Q62280 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ss18Q62280 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ss18Q62280 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ss18Q62280 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ss18Q62280 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ss18Q62280 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ss18Q62280 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ss18Q62280 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ss18Q62280 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ss18Q62280 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ss18Q62280 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ss18Q62280 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ss18Q62280 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ss18Q62280 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ss18Q62280 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ss18Q62280 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ss18Q62280 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ss18Q62280 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ss18Q62280 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ss18Q62280 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ss18Q62280 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ss18Q62280 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ss18Q62280 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ss18Q62280 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ss18Q62280 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ss18Q62280 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ss18Q62280 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ss18Q62280 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ss18Q62280 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ss18Q62280 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ss18Q62280 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ss18Q62280 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ss18Q62280 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ss18Q62280 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ss18Q62280 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ss18Q62280 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ss18Q62280 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ss18Q62280 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms