Protein–RNA interactions for Protein: Q62277

Syp, Synaptophysin, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SypQ62277 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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SypQ62277 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SypQ62277 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SypQ62277 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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SypQ62277 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SypQ62277 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SypQ62277 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SypQ62277 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SypQ62277 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SypQ62277 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SypQ62277 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SypQ62277 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SypQ62277 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SypQ62277 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SypQ62277 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SypQ62277 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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