Protein–RNA interactions for Protein: Q61500

Itm2a, Integral membrane protein 2A, mousemouse

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Length 263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itm2aQ61500 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Itm2aQ61500 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itm2aQ61500 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itm2aQ61500 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itm2aQ61500 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itm2aQ61500 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itm2aQ61500 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itm2aQ61500 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itm2aQ61500 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itm2aQ61500 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itm2aQ61500 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itm2aQ61500 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itm2aQ61500 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itm2aQ61500 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itm2aQ61500 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itm2aQ61500 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itm2aQ61500 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itm2aQ61500 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itm2aQ61500 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itm2aQ61500 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itm2aQ61500 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itm2aQ61500 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itm2aQ61500 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itm2aQ61500 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itm2aQ61500 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itm2aQ61500 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itm2aQ61500 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itm2aQ61500 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itm2aQ61500 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Itm2aQ61500 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itm2aQ61500 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itm2aQ61500 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itm2aQ61500 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itm2aQ61500 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itm2aQ61500 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Itm2aQ61500 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itm2aQ61500 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itm2aQ61500 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itm2aQ61500 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itm2aQ61500 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itm2aQ61500 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itm2aQ61500 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itm2aQ61500 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itm2aQ61500 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itm2aQ61500 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itm2aQ61500 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itm2aQ61500 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itm2aQ61500 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itm2aQ61500 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Itm2aQ61500 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Itm2aQ61500 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Itm2aQ61500 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Itm2aQ61500 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Itm2aQ61500 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itm2aQ61500 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itm2aQ61500 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itm2aQ61500 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itm2aQ61500 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itm2aQ61500 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Itm2aQ61500 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itm2aQ61500 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itm2aQ61500 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itm2aQ61500 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Itm2aQ61500 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itm2aQ61500 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itm2aQ61500 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itm2aQ61500 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itm2aQ61500 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itm2aQ61500 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itm2aQ61500 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itm2aQ61500 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itm2aQ61500 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itm2aQ61500 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itm2aQ61500 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itm2aQ61500 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itm2aQ61500 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itm2aQ61500 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itm2aQ61500 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itm2aQ61500 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itm2aQ61500 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itm2aQ61500 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itm2aQ61500 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itm2aQ61500 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itm2aQ61500 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itm2aQ61500 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itm2aQ61500 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Itm2aQ61500 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itm2aQ61500 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itm2aQ61500 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itm2aQ61500 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itm2aQ61500 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itm2aQ61500 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itm2aQ61500 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itm2aQ61500 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itm2aQ61500 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itm2aQ61500 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itm2aQ61500 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itm2aQ61500 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itm2aQ61500 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itm2aQ61500 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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