Protein–RNA interactions for Protein: Q61290

Cacna1e, Voltage-dependent R-type calcium channel subunit alpha-1E, mousemouse

Predictions only

Length 2,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1eQ61290 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna1eQ61290 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna1eQ61290 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna1eQ61290 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna1eQ61290 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna1eQ61290 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna1eQ61290 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna1eQ61290 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna1eQ61290 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna1eQ61290 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna1eQ61290 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna1eQ61290 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna1eQ61290 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna1eQ61290 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna1eQ61290 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna1eQ61290 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna1eQ61290 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna1eQ61290 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna1eQ61290 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna1eQ61290 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna1eQ61290 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna1eQ61290 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna1eQ61290 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna1eQ61290 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna1eQ61290 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1eQ61290 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1eQ61290 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1eQ61290 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1eQ61290 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1eQ61290 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1eQ61290 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1eQ61290 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1eQ61290 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1eQ61290 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1eQ61290 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1eQ61290 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1eQ61290 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1eQ61290 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1eQ61290 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1eQ61290 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1eQ61290 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1eQ61290 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1eQ61290 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1eQ61290 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1eQ61290 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1eQ61290 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1eQ61290 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1eQ61290 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1eQ61290 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1eQ61290 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1eQ61290 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1eQ61290 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1eQ61290 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1eQ61290 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1eQ61290 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1eQ61290 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1eQ61290 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1eQ61290 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1eQ61290 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1eQ61290 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1eQ61290 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1eQ61290 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1eQ61290 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1eQ61290 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1eQ61290 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1eQ61290 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1eQ61290 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1eQ61290 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1eQ61290 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1eQ61290 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1eQ61290 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1eQ61290 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1eQ61290 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1eQ61290 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1eQ61290 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1eQ61290 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1eQ61290 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1eQ61290 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1eQ61290 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacna1eQ61290 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacna1eQ61290 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacna1eQ61290 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacna1eQ61290 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacna1eQ61290 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacna1eQ61290 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacna1eQ61290 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacna1eQ61290 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacna1eQ61290 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacna1eQ61290 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacna1eQ61290 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacna1eQ61290 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacna1eQ61290 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacna1eQ61290 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacna1eQ61290 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacna1eQ61290 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacna1eQ61290 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacna1eQ61290 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacna1eQ61290 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacna1eQ61290 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacna1eQ61290 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms