Protein–RNA interactions for Protein: Q61136

Prpf4b, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf4bQ61136 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prpf4bQ61136 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prpf4bQ61136 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prpf4bQ61136 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prpf4bQ61136 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prpf4bQ61136 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prpf4bQ61136 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prpf4bQ61136 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prpf4bQ61136 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prpf4bQ61136 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prpf4bQ61136 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prpf4bQ61136 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prpf4bQ61136 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prpf4bQ61136 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prpf4bQ61136 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prpf4bQ61136 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prpf4bQ61136 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prpf4bQ61136 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prpf4bQ61136 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Prpf4bQ61136 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Prpf4bQ61136 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prpf4bQ61136 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prpf4bQ61136 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prpf4bQ61136 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Prpf4bQ61136 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prpf4bQ61136 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Prpf4bQ61136 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prpf4bQ61136 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prpf4bQ61136 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prpf4bQ61136 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prpf4bQ61136 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prpf4bQ61136 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prpf4bQ61136 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Prpf4bQ61136 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prpf4bQ61136 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prpf4bQ61136 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prpf4bQ61136 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prpf4bQ61136 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prpf4bQ61136 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prpf4bQ61136 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prpf4bQ61136 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prpf4bQ61136 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prpf4bQ61136 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prpf4bQ61136 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prpf4bQ61136 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prpf4bQ61136 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prpf4bQ61136 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prpf4bQ61136 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prpf4bQ61136 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prpf4bQ61136 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prpf4bQ61136 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prpf4bQ61136 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prpf4bQ61136 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prpf4bQ61136 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prpf4bQ61136 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Prpf4bQ61136 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prpf4bQ61136 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prpf4bQ61136 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prpf4bQ61136 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prpf4bQ61136 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prpf4bQ61136 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prpf4bQ61136 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prpf4bQ61136 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prpf4bQ61136 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prpf4bQ61136 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prpf4bQ61136 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prpf4bQ61136 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prpf4bQ61136 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prpf4bQ61136 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prpf4bQ61136 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prpf4bQ61136 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prpf4bQ61136 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prpf4bQ61136 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prpf4bQ61136 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prpf4bQ61136 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prpf4bQ61136 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prpf4bQ61136 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prpf4bQ61136 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prpf4bQ61136 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prpf4bQ61136 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prpf4bQ61136 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prpf4bQ61136 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prpf4bQ61136 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prpf4bQ61136 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prpf4bQ61136 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prpf4bQ61136 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prpf4bQ61136 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prpf4bQ61136 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prpf4bQ61136 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prpf4bQ61136 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prpf4bQ61136 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prpf4bQ61136 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prpf4bQ61136 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prpf4bQ61136 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prpf4bQ61136 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prpf4bQ61136 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prpf4bQ61136 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prpf4bQ61136 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prpf4bQ61136 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prpf4bQ61136 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms