Protein–RNA interactions for Protein: Q61096

Prtn3, Myeloblastin, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prtn3Q61096 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prtn3Q61096 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prtn3Q61096 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prtn3Q61096 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prtn3Q61096 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prtn3Q61096 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prtn3Q61096 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prtn3Q61096 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prtn3Q61096 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prtn3Q61096 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prtn3Q61096 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Prtn3Q61096 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prtn3Q61096 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Prtn3Q61096 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Prtn3Q61096 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Prtn3Q61096 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prtn3Q61096 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prtn3Q61096 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prtn3Q61096 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prtn3Q61096 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prtn3Q61096 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prtn3Q61096 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prtn3Q61096 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prtn3Q61096 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prtn3Q61096 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prtn3Q61096 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prtn3Q61096 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prtn3Q61096 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prtn3Q61096 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prtn3Q61096 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prtn3Q61096 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prtn3Q61096 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prtn3Q61096 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prtn3Q61096 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prtn3Q61096 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prtn3Q61096 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prtn3Q61096 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prtn3Q61096 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prtn3Q61096 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prtn3Q61096 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prtn3Q61096 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prtn3Q61096 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prtn3Q61096 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prtn3Q61096 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prtn3Q61096 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Prtn3Q61096 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prtn3Q61096 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prtn3Q61096 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Prtn3Q61096 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Prtn3Q61096 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prtn3Q61096 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prtn3Q61096 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prtn3Q61096 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prtn3Q61096 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prtn3Q61096 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prtn3Q61096 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prtn3Q61096 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prtn3Q61096 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prtn3Q61096 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prtn3Q61096 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prtn3Q61096 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prtn3Q61096 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prtn3Q61096 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prtn3Q61096 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prtn3Q61096 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prtn3Q61096 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prtn3Q61096 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prtn3Q61096 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prtn3Q61096 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prtn3Q61096 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prtn3Q61096 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prtn3Q61096 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prtn3Q61096 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prtn3Q61096 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prtn3Q61096 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prtn3Q61096 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prtn3Q61096 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prtn3Q61096 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prtn3Q61096 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prtn3Q61096 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prtn3Q61096 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prtn3Q61096 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prtn3Q61096 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prtn3Q61096 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prtn3Q61096 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prtn3Q61096 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prtn3Q61096 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prtn3Q61096 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prtn3Q61096 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prtn3Q61096 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prtn3Q61096 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prtn3Q61096 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prtn3Q61096 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prtn3Q61096 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prtn3Q61096 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prtn3Q61096 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prtn3Q61096 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prtn3Q61096 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prtn3Q61096 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prtn3Q61096 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms