Protein–RNA interactions for Protein: Q60934

Grik1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik1Q60934 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Grik1Q60934 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Grik1Q60934 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Grik1Q60934 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Grik1Q60934 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Grik1Q60934 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Grik1Q60934 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Grik1Q60934 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Grik1Q60934 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Grik1Q60934 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Grik1Q60934 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Grik1Q60934 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Grik1Q60934 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Grik1Q60934 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Grik1Q60934 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Grik1Q60934 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Grik1Q60934 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Grik1Q60934 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Grik1Q60934 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Grik1Q60934 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Grik1Q60934 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Grik1Q60934 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Grik1Q60934 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Grik1Q60934 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Grik1Q60934 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Grik1Q60934 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Grik1Q60934 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Grik1Q60934 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Grik1Q60934 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Grik1Q60934 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Grik1Q60934 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Grik1Q60934 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Grik1Q60934 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Grik1Q60934 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Grik1Q60934 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Grik1Q60934 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Grik1Q60934 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Grik1Q60934 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Grik1Q60934 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Grik1Q60934 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Grik1Q60934 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Grik1Q60934 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Grik1Q60934 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Grik1Q60934 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Grik1Q60934 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Grik1Q60934 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Grik1Q60934 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Grik1Q60934 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Grik1Q60934 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Grik1Q60934 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Grik1Q60934 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Grik1Q60934 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Grik1Q60934 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Grik1Q60934 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Grik1Q60934 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Grik1Q60934 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Grik1Q60934 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Grik1Q60934 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Grik1Q60934 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Grik1Q60934 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Grik1Q60934 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Grik1Q60934 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Grik1Q60934 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Grik1Q60934 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Grik1Q60934 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Grik1Q60934 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Grik1Q60934 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Grik1Q60934 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Grik1Q60934 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Grik1Q60934 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Grik1Q60934 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Grik1Q60934 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Grik1Q60934 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Grik1Q60934 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Grik1Q60934 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Grik1Q60934 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Grik1Q60934 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Grik1Q60934 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Grik1Q60934 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Grik1Q60934 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Grik1Q60934 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Grik1Q60934 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Grik1Q60934 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Grik1Q60934 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Grik1Q60934 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Grik1Q60934 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Grik1Q60934 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Grik1Q60934 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Grik1Q60934 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Grik1Q60934 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Grik1Q60934 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Grik1Q60934 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Grik1Q60934 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Grik1Q60934 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Grik1Q60934 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Grik1Q60934 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Grik1Q60934 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Grik1Q60934 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Grik1Q60934 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Grik1Q60934 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.9 ms