Protein–RNA interactions for Protein: Q60688

Foxd4, Forkhead box protein D4, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd4Q60688 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Foxd4Q60688 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Foxd4Q60688 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Foxd4Q60688 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Foxd4Q60688 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Foxd4Q60688 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Foxd4Q60688 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Foxd4Q60688 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Foxd4Q60688 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Foxd4Q60688 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Foxd4Q60688 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Foxd4Q60688 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Foxd4Q60688 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Foxd4Q60688 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Foxd4Q60688 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Foxd4Q60688 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Foxd4Q60688 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Foxd4Q60688 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Foxd4Q60688 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Foxd4Q60688 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Foxd4Q60688 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Foxd4Q60688 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Foxd4Q60688 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Foxd4Q60688 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Foxd4Q60688 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Foxd4Q60688 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Foxd4Q60688 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Foxd4Q60688 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Foxd4Q60688 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Foxd4Q60688 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Foxd4Q60688 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Foxd4Q60688 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Foxd4Q60688 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Foxd4Q60688 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Foxd4Q60688 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Foxd4Q60688 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Foxd4Q60688 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Foxd4Q60688 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Foxd4Q60688 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Foxd4Q60688 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Foxd4Q60688 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Foxd4Q60688 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Foxd4Q60688 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Foxd4Q60688 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Foxd4Q60688 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Foxd4Q60688 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Foxd4Q60688 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Foxd4Q60688 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Foxd4Q60688 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Foxd4Q60688 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Foxd4Q60688 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Foxd4Q60688 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Foxd4Q60688 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Foxd4Q60688 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Foxd4Q60688 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Foxd4Q60688 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Foxd4Q60688 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Foxd4Q60688 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Foxd4Q60688 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Foxd4Q60688 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Foxd4Q60688 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Foxd4Q60688 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Foxd4Q60688 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Foxd4Q60688 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Foxd4Q60688 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Foxd4Q60688 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Foxd4Q60688 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Foxd4Q60688 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Foxd4Q60688 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Foxd4Q60688 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Foxd4Q60688 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Foxd4Q60688 Tmem150cos-201ENSMUST00000143245 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Foxd4Q60688 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Foxd4Q60688 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Foxd4Q60688 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Foxd4Q60688 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Foxd4Q60688 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Foxd4Q60688 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Foxd4Q60688 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Foxd4Q60688 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Foxd4Q60688 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Foxd4Q60688 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Foxd4Q60688 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Foxd4Q60688 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Foxd4Q60688 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Foxd4Q60688 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Foxd4Q60688 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Foxd4Q60688 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Foxd4Q60688 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Foxd4Q60688 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Foxd4Q60688 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Foxd4Q60688 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Foxd4Q60688 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Foxd4Q60688 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Foxd4Q60688 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Foxd4Q60688 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Foxd4Q60688 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Foxd4Q60688 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Foxd4Q60688 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Foxd4Q60688 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms