Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4D8

Slc5a6, Sodium-dependent multivitamin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a6Q5U4D8 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc5a6Q5U4D8 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc5a6Q5U4D8 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc5a6Q5U4D8 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc5a6Q5U4D8 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc5a6Q5U4D8 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc5a6Q5U4D8 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc5a6Q5U4D8 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc5a6Q5U4D8 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc5a6Q5U4D8 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc5a6Q5U4D8 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc5a6Q5U4D8 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc5a6Q5U4D8 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc5a6Q5U4D8 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc5a6Q5U4D8 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc5a6Q5U4D8 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc5a6Q5U4D8 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc5a6Q5U4D8 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc5a6Q5U4D8 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc5a6Q5U4D8 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc5a6Q5U4D8 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc5a6Q5U4D8 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc5a6Q5U4D8 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc5a6Q5U4D8 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc5a6Q5U4D8 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc5a6Q5U4D8 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc5a6Q5U4D8 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc5a6Q5U4D8 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc5a6Q5U4D8 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc5a6Q5U4D8 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc5a6Q5U4D8 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc5a6Q5U4D8 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc5a6Q5U4D8 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc5a6Q5U4D8 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc5a6Q5U4D8 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc5a6Q5U4D8 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc5a6Q5U4D8 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc5a6Q5U4D8 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc5a6Q5U4D8 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc5a6Q5U4D8 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc5a6Q5U4D8 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc5a6Q5U4D8 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc5a6Q5U4D8 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc5a6Q5U4D8 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc5a6Q5U4D8 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc5a6Q5U4D8 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc5a6Q5U4D8 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc5a6Q5U4D8 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc5a6Q5U4D8 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc5a6Q5U4D8 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc5a6Q5U4D8 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc5a6Q5U4D8 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc5a6Q5U4D8 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc5a6Q5U4D8 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc5a6Q5U4D8 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc5a6Q5U4D8 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc5a6Q5U4D8 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc5a6Q5U4D8 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc5a6Q5U4D8 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc5a6Q5U4D8 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc5a6Q5U4D8 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc5a6Q5U4D8 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc5a6Q5U4D8 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc5a6Q5U4D8 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc5a6Q5U4D8 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Slc5a6Q5U4D8 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Slc5a6Q5U4D8 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Slc5a6Q5U4D8 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slc5a6Q5U4D8 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slc5a6Q5U4D8 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slc5a6Q5U4D8 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slc5a6Q5U4D8 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slc5a6Q5U4D8 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slc5a6Q5U4D8 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slc5a6Q5U4D8 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slc5a6Q5U4D8 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Slc5a6Q5U4D8 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slc5a6Q5U4D8 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Slc5a6Q5U4D8 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Slc5a6Q5U4D8 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slc5a6Q5U4D8 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slc5a6Q5U4D8 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slc5a6Q5U4D8 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slc5a6Q5U4D8 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slc5a6Q5U4D8 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slc5a6Q5U4D8 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slc5a6Q5U4D8 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slc5a6Q5U4D8 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slc5a6Q5U4D8 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slc5a6Q5U4D8 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slc5a6Q5U4D8 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Slc5a6Q5U4D8 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slc5a6Q5U4D8 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc5a6Q5U4D8 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc5a6Q5U4D8 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc5a6Q5U4D8 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc5a6Q5U4D8 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc5a6Q5U4D8 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc5a6Q5U4D8 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc5a6Q5U4D8 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms