Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUC9

Sco1, Protein SCO1 homolog, mitochondrial, mousemouse

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Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sco1Q5SUC9 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sco1Q5SUC9 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Sco1Q5SUC9 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Sco1Q5SUC9 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sco1Q5SUC9 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sco1Q5SUC9 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Sco1Q5SUC9 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Sco1Q5SUC9 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sco1Q5SUC9 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sco1Q5SUC9 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sco1Q5SUC9 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sco1Q5SUC9 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sco1Q5SUC9 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sco1Q5SUC9 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Sco1Q5SUC9 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Sco1Q5SUC9 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sco1Q5SUC9 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sco1Q5SUC9 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sco1Q5SUC9 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sco1Q5SUC9 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sco1Q5SUC9 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sco1Q5SUC9 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sco1Q5SUC9 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sco1Q5SUC9 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sco1Q5SUC9 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sco1Q5SUC9 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sco1Q5SUC9 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sco1Q5SUC9 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sco1Q5SUC9 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sco1Q5SUC9 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sco1Q5SUC9 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sco1Q5SUC9 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sco1Q5SUC9 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sco1Q5SUC9 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sco1Q5SUC9 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sco1Q5SUC9 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Sco1Q5SUC9 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sco1Q5SUC9 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sco1Q5SUC9 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sco1Q5SUC9 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sco1Q5SUC9 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sco1Q5SUC9 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sco1Q5SUC9 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sco1Q5SUC9 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sco1Q5SUC9 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sco1Q5SUC9 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sco1Q5SUC9 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sco1Q5SUC9 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sco1Q5SUC9 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
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Sco1Q5SUC9 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sco1Q5SUC9 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sco1Q5SUC9 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sco1Q5SUC9 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sco1Q5SUC9 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sco1Q5SUC9 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sco1Q5SUC9 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sco1Q5SUC9 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sco1Q5SUC9 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sco1Q5SUC9 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sco1Q5SUC9 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sco1Q5SUC9 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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Sco1Q5SUC9 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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Sco1Q5SUC9 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sco1Q5SUC9 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
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Sco1Q5SUC9 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sco1Q5SUC9 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sco1Q5SUC9 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sco1Q5SUC9 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sco1Q5SUC9 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sco1Q5SUC9 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sco1Q5SUC9 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sco1Q5SUC9 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sco1Q5SUC9 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sco1Q5SUC9 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sco1Q5SUC9 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sco1Q5SUC9 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sco1Q5SUC9 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sco1Q5SUC9 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sco1Q5SUC9 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sco1Q5SUC9 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sco1Q5SUC9 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sco1Q5SUC9 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sco1Q5SUC9 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Sco1Q5SUC9 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sco1Q5SUC9 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sco1Q5SUC9 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Sco1Q5SUC9 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sco1Q5SUC9 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sco1Q5SUC9 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sco1Q5SUC9 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sco1Q5SUC9 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sco1Q5SUC9 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Sco1Q5SUC9 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms