Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRT8

Ccnjl, Cyclin-J-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnjlQ5SRT8 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CcnjlQ5SRT8 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CcnjlQ5SRT8 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CcnjlQ5SRT8 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CcnjlQ5SRT8 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CcnjlQ5SRT8 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CcnjlQ5SRT8 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CcnjlQ5SRT8 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CcnjlQ5SRT8 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CcnjlQ5SRT8 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CcnjlQ5SRT8 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CcnjlQ5SRT8 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CcnjlQ5SRT8 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CcnjlQ5SRT8 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CcnjlQ5SRT8 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CcnjlQ5SRT8 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CcnjlQ5SRT8 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CcnjlQ5SRT8 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CcnjlQ5SRT8 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CcnjlQ5SRT8 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CcnjlQ5SRT8 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CcnjlQ5SRT8 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CcnjlQ5SRT8 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CcnjlQ5SRT8 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CcnjlQ5SRT8 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CcnjlQ5SRT8 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CcnjlQ5SRT8 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CcnjlQ5SRT8 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CcnjlQ5SRT8 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CcnjlQ5SRT8 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CcnjlQ5SRT8 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CcnjlQ5SRT8 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CcnjlQ5SRT8 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CcnjlQ5SRT8 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CcnjlQ5SRT8 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CcnjlQ5SRT8 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CcnjlQ5SRT8 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CcnjlQ5SRT8 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CcnjlQ5SRT8 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CcnjlQ5SRT8 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CcnjlQ5SRT8 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CcnjlQ5SRT8 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CcnjlQ5SRT8 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CcnjlQ5SRT8 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CcnjlQ5SRT8 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CcnjlQ5SRT8 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CcnjlQ5SRT8 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CcnjlQ5SRT8 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CcnjlQ5SRT8 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CcnjlQ5SRT8 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CcnjlQ5SRT8 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CcnjlQ5SRT8 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CcnjlQ5SRT8 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CcnjlQ5SRT8 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CcnjlQ5SRT8 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CcnjlQ5SRT8 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CcnjlQ5SRT8 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CcnjlQ5SRT8 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CcnjlQ5SRT8 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CcnjlQ5SRT8 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CcnjlQ5SRT8 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CcnjlQ5SRT8 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CcnjlQ5SRT8 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CcnjlQ5SRT8 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CcnjlQ5SRT8 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CcnjlQ5SRT8 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CcnjlQ5SRT8 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CcnjlQ5SRT8 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CcnjlQ5SRT8 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CcnjlQ5SRT8 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CcnjlQ5SRT8 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CcnjlQ5SRT8 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CcnjlQ5SRT8 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CcnjlQ5SRT8 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CcnjlQ5SRT8 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CcnjlQ5SRT8 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CcnjlQ5SRT8 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CcnjlQ5SRT8 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CcnjlQ5SRT8 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CcnjlQ5SRT8 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CcnjlQ5SRT8 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CcnjlQ5SRT8 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CcnjlQ5SRT8 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CcnjlQ5SRT8 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CcnjlQ5SRT8 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CcnjlQ5SRT8 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CcnjlQ5SRT8 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CcnjlQ5SRT8 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CcnjlQ5SRT8 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CcnjlQ5SRT8 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CcnjlQ5SRT8 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CcnjlQ5SRT8 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CcnjlQ5SRT8 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CcnjlQ5SRT8 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CcnjlQ5SRT8 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CcnjlQ5SRT8 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CcnjlQ5SRT8 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CcnjlQ5SRT8 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CcnjlQ5SRT8 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CcnjlQ5SRT8 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms