Protein–RNA interactions for Protein: Q5FWH3

Grhl3, Grainyhead-like protein 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grhl3Q5FWH3 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Grhl3Q5FWH3 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Grhl3Q5FWH3 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Grhl3Q5FWH3 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Grhl3Q5FWH3 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Grhl3Q5FWH3 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Grhl3Q5FWH3 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Grhl3Q5FWH3 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Grhl3Q5FWH3 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Grhl3Q5FWH3 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Grhl3Q5FWH3 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Grhl3Q5FWH3 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Grhl3Q5FWH3 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Grhl3Q5FWH3 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Grhl3Q5FWH3 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Grhl3Q5FWH3 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Grhl3Q5FWH3 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Grhl3Q5FWH3 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Grhl3Q5FWH3 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Grhl3Q5FWH3 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Grhl3Q5FWH3 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Grhl3Q5FWH3 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Grhl3Q5FWH3 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Grhl3Q5FWH3 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Grhl3Q5FWH3 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Grhl3Q5FWH3 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Grhl3Q5FWH3 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Grhl3Q5FWH3 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Grhl3Q5FWH3 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Grhl3Q5FWH3 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Grhl3Q5FWH3 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Grhl3Q5FWH3 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Grhl3Q5FWH3 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Grhl3Q5FWH3 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Grhl3Q5FWH3 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Grhl3Q5FWH3 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Grhl3Q5FWH3 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Grhl3Q5FWH3 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Grhl3Q5FWH3 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Grhl3Q5FWH3 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Grhl3Q5FWH3 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Grhl3Q5FWH3 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Grhl3Q5FWH3 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Grhl3Q5FWH3 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Grhl3Q5FWH3 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grhl3Q5FWH3 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grhl3Q5FWH3 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grhl3Q5FWH3 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grhl3Q5FWH3 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grhl3Q5FWH3 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grhl3Q5FWH3 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grhl3Q5FWH3 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grhl3Q5FWH3 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grhl3Q5FWH3 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grhl3Q5FWH3 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grhl3Q5FWH3 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grhl3Q5FWH3 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grhl3Q5FWH3 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Grhl3Q5FWH3 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grhl3Q5FWH3 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Grhl3Q5FWH3 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grhl3Q5FWH3 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Grhl3Q5FWH3 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grhl3Q5FWH3 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grhl3Q5FWH3 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grhl3Q5FWH3 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grhl3Q5FWH3 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grhl3Q5FWH3 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grhl3Q5FWH3 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grhl3Q5FWH3 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Grhl3Q5FWH3 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grhl3Q5FWH3 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grhl3Q5FWH3 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grhl3Q5FWH3 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grhl3Q5FWH3 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grhl3Q5FWH3 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grhl3Q5FWH3 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grhl3Q5FWH3 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grhl3Q5FWH3 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grhl3Q5FWH3 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grhl3Q5FWH3 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grhl3Q5FWH3 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grhl3Q5FWH3 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grhl3Q5FWH3 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grhl3Q5FWH3 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grhl3Q5FWH3 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grhl3Q5FWH3 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grhl3Q5FWH3 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grhl3Q5FWH3 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grhl3Q5FWH3 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grhl3Q5FWH3 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grhl3Q5FWH3 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Grhl3Q5FWH3 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grhl3Q5FWH3 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grhl3Q5FWH3 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grhl3Q5FWH3 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Grhl3Q5FWH3 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Grhl3Q5FWH3 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Grhl3Q5FWH3 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grhl3Q5FWH3 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms