Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTK1

Chsy3, Chondroitin sulfate synthase 3, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chsy3Q5DTK1 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chsy3Q5DTK1 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chsy3Q5DTK1 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chsy3Q5DTK1 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chsy3Q5DTK1 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chsy3Q5DTK1 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chsy3Q5DTK1 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chsy3Q5DTK1 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chsy3Q5DTK1 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chsy3Q5DTK1 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chsy3Q5DTK1 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chsy3Q5DTK1 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chsy3Q5DTK1 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Chsy3Q5DTK1 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chsy3Q5DTK1 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Chsy3Q5DTK1 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chsy3Q5DTK1 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chsy3Q5DTK1 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chsy3Q5DTK1 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chsy3Q5DTK1 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chsy3Q5DTK1 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chsy3Q5DTK1 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chsy3Q5DTK1 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chsy3Q5DTK1 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chsy3Q5DTK1 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chsy3Q5DTK1 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chsy3Q5DTK1 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chsy3Q5DTK1 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chsy3Q5DTK1 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chsy3Q5DTK1 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chsy3Q5DTK1 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chsy3Q5DTK1 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Chsy3Q5DTK1 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chsy3Q5DTK1 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chsy3Q5DTK1 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Chsy3Q5DTK1 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chsy3Q5DTK1 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chsy3Q5DTK1 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chsy3Q5DTK1 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chsy3Q5DTK1 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chsy3Q5DTK1 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chsy3Q5DTK1 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chsy3Q5DTK1 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chsy3Q5DTK1 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chsy3Q5DTK1 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chsy3Q5DTK1 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chsy3Q5DTK1 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chsy3Q5DTK1 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chsy3Q5DTK1 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chsy3Q5DTK1 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chsy3Q5DTK1 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Chsy3Q5DTK1 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Chsy3Q5DTK1 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Chsy3Q5DTK1 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Chsy3Q5DTK1 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Chsy3Q5DTK1 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Chsy3Q5DTK1 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Chsy3Q5DTK1 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Chsy3Q5DTK1 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Chsy3Q5DTK1 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Chsy3Q5DTK1 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Chsy3Q5DTK1 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Chsy3Q5DTK1 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Chsy3Q5DTK1 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Chsy3Q5DTK1 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Chsy3Q5DTK1 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Chsy3Q5DTK1 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Chsy3Q5DTK1 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Chsy3Q5DTK1 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Chsy3Q5DTK1 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Chsy3Q5DTK1 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Chsy3Q5DTK1 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Chsy3Q5DTK1 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Chsy3Q5DTK1 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Chsy3Q5DTK1 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Chsy3Q5DTK1 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Chsy3Q5DTK1 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chsy3Q5DTK1 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chsy3Q5DTK1 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chsy3Q5DTK1 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chsy3Q5DTK1 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chsy3Q5DTK1 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chsy3Q5DTK1 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chsy3Q5DTK1 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chsy3Q5DTK1 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chsy3Q5DTK1 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chsy3Q5DTK1 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chsy3Q5DTK1 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chsy3Q5DTK1 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chsy3Q5DTK1 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chsy3Q5DTK1 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chsy3Q5DTK1 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chsy3Q5DTK1 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Chsy3Q5DTK1 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chsy3Q5DTK1 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chsy3Q5DTK1 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chsy3Q5DTK1 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Chsy3Q5DTK1 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chsy3Q5DTK1 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chsy3Q5DTK1 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms