Protein–RNA interactions for Protein: Q587J6

L1td1, LINE-1 type transposase domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1td1Q587J6 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
L1td1Q587J6 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
L1td1Q587J6 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
L1td1Q587J6 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
L1td1Q587J6 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
L1td1Q587J6 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
L1td1Q587J6 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
L1td1Q587J6 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
L1td1Q587J6 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
L1td1Q587J6 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
L1td1Q587J6 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
L1td1Q587J6 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
L1td1Q587J6 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
L1td1Q587J6 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
L1td1Q587J6 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
L1td1Q587J6 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
L1td1Q587J6 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
L1td1Q587J6 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
L1td1Q587J6 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
L1td1Q587J6 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
L1td1Q587J6 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
L1td1Q587J6 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
L1td1Q587J6 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
L1td1Q587J6 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
L1td1Q587J6 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
L1td1Q587J6 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
L1td1Q587J6 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
L1td1Q587J6 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
L1td1Q587J6 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
L1td1Q587J6 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
L1td1Q587J6 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
L1td1Q587J6 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
L1td1Q587J6 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
L1td1Q587J6 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
L1td1Q587J6 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
L1td1Q587J6 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
L1td1Q587J6 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
L1td1Q587J6 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
L1td1Q587J6 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
L1td1Q587J6 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
L1td1Q587J6 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
L1td1Q587J6 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
L1td1Q587J6 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
L1td1Q587J6 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
L1td1Q587J6 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
L1td1Q587J6 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
L1td1Q587J6 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
L1td1Q587J6 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
L1td1Q587J6 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
L1td1Q587J6 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
L1td1Q587J6 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
L1td1Q587J6 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
L1td1Q587J6 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
L1td1Q587J6 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
L1td1Q587J6 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
L1td1Q587J6 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
L1td1Q587J6 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
L1td1Q587J6 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
L1td1Q587J6 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
L1td1Q587J6 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
L1td1Q587J6 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
L1td1Q587J6 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
L1td1Q587J6 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
L1td1Q587J6 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
L1td1Q587J6 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
L1td1Q587J6 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
L1td1Q587J6 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
L1td1Q587J6 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
L1td1Q587J6 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
L1td1Q587J6 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
L1td1Q587J6 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
L1td1Q587J6 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
L1td1Q587J6 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
L1td1Q587J6 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
L1td1Q587J6 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
L1td1Q587J6 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
L1td1Q587J6 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
L1td1Q587J6 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
L1td1Q587J6 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
L1td1Q587J6 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
L1td1Q587J6 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
L1td1Q587J6 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
L1td1Q587J6 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
L1td1Q587J6 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
L1td1Q587J6 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
L1td1Q587J6 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
L1td1Q587J6 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
L1td1Q587J6 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
L1td1Q587J6 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
L1td1Q587J6 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
L1td1Q587J6 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
L1td1Q587J6 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
L1td1Q587J6 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
L1td1Q587J6 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
L1td1Q587J6 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
L1td1Q587J6 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
L1td1Q587J6 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
L1td1Q587J6 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
L1td1Q587J6 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
L1td1Q587J6 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms