Protein–RNA interactions for Protein: Q56A10

Znf608, Zinc finger protein 608, mousemouse

Predictions only

Length 1,511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf608Q56A10 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Znf608Q56A10 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Znf608Q56A10 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Znf608Q56A10 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Znf608Q56A10 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Znf608Q56A10 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Znf608Q56A10 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Znf608Q56A10 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Znf608Q56A10 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Znf608Q56A10 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Znf608Q56A10 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Znf608Q56A10 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Znf608Q56A10 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Znf608Q56A10 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Znf608Q56A10 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Znf608Q56A10 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Znf608Q56A10 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Znf608Q56A10 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Znf608Q56A10 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Znf608Q56A10 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Znf608Q56A10 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Znf608Q56A10 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Znf608Q56A10 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Znf608Q56A10 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Znf608Q56A10 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Znf608Q56A10 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Znf608Q56A10 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Znf608Q56A10 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Znf608Q56A10 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Znf608Q56A10 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Znf608Q56A10 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Znf608Q56A10 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Znf608Q56A10 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Znf608Q56A10 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Znf608Q56A10 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Znf608Q56A10 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Znf608Q56A10 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Znf608Q56A10 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Znf608Q56A10 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Znf608Q56A10 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Znf608Q56A10 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Znf608Q56A10 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Znf608Q56A10 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Znf608Q56A10 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Znf608Q56A10 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Znf608Q56A10 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Znf608Q56A10 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Znf608Q56A10 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Znf608Q56A10 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Znf608Q56A10 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Znf608Q56A10 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Znf608Q56A10 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Znf608Q56A10 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Znf608Q56A10 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Znf608Q56A10 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Znf608Q56A10 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Znf608Q56A10 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Znf608Q56A10 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Znf608Q56A10 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Znf608Q56A10 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Znf608Q56A10 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Znf608Q56A10 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Znf608Q56A10 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Znf608Q56A10 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Znf608Q56A10 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Znf608Q56A10 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Znf608Q56A10 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Znf608Q56A10 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Znf608Q56A10 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Znf608Q56A10 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Znf608Q56A10 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Znf608Q56A10 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Znf608Q56A10 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Znf608Q56A10 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Znf608Q56A10 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Znf608Q56A10 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Znf608Q56A10 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Znf608Q56A10 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Znf608Q56A10 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Znf608Q56A10 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Znf608Q56A10 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Znf608Q56A10 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Znf608Q56A10 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Znf608Q56A10 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Znf608Q56A10 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Znf608Q56A10 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Znf608Q56A10 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Znf608Q56A10 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Znf608Q56A10 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Znf608Q56A10 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Znf608Q56A10 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Znf608Q56A10 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Znf608Q56A10 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Znf608Q56A10 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Znf608Q56A10 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Znf608Q56A10 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Znf608Q56A10 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Znf608Q56A10 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Znf608Q56A10 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Znf608Q56A10 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms