Protein–RNA interactions for Protein: Q505G4

Rtl6, Retrotransposon Gag-like protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl6Q505G4 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rtl6Q505G4 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rtl6Q505G4 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rtl6Q505G4 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rtl6Q505G4 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rtl6Q505G4 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rtl6Q505G4 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rtl6Q505G4 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rtl6Q505G4 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rtl6Q505G4 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rtl6Q505G4 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rtl6Q505G4 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rtl6Q505G4 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rtl6Q505G4 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rtl6Q505G4 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rtl6Q505G4 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rtl6Q505G4 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rtl6Q505G4 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rtl6Q505G4 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rtl6Q505G4 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rtl6Q505G4 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rtl6Q505G4 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rtl6Q505G4 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rtl6Q505G4 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rtl6Q505G4 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rtl6Q505G4 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rtl6Q505G4 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rtl6Q505G4 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rtl6Q505G4 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rtl6Q505G4 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rtl6Q505G4 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rtl6Q505G4 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rtl6Q505G4 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rtl6Q505G4 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rtl6Q505G4 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rtl6Q505G4 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rtl6Q505G4 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rtl6Q505G4 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rtl6Q505G4 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rtl6Q505G4 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Rtl6Q505G4 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rtl6Q505G4 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rtl6Q505G4 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rtl6Q505G4 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rtl6Q505G4 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rtl6Q505G4 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rtl6Q505G4 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rtl6Q505G4 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rtl6Q505G4 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rtl6Q505G4 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rtl6Q505G4 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rtl6Q505G4 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rtl6Q505G4 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rtl6Q505G4 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rtl6Q505G4 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rtl6Q505G4 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rtl6Q505G4 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rtl6Q505G4 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rtl6Q505G4 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Rtl6Q505G4 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rtl6Q505G4 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rtl6Q505G4 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rtl6Q505G4 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rtl6Q505G4 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rtl6Q505G4 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rtl6Q505G4 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rtl6Q505G4 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rtl6Q505G4 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rtl6Q505G4 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rtl6Q505G4 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rtl6Q505G4 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rtl6Q505G4 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rtl6Q505G4 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rtl6Q505G4 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rtl6Q505G4 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rtl6Q505G4 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rtl6Q505G4 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rtl6Q505G4 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rtl6Q505G4 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rtl6Q505G4 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rtl6Q505G4 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rtl6Q505G4 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rtl6Q505G4 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Rtl6Q505G4 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rtl6Q505G4 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rtl6Q505G4 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rtl6Q505G4 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rtl6Q505G4 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rtl6Q505G4 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rtl6Q505G4 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rtl6Q505G4 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rtl6Q505G4 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rtl6Q505G4 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rtl6Q505G4 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rtl6Q505G4 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rtl6Q505G4 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rtl6Q505G4 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rtl6Q505G4 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rtl6Q505G4 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rtl6Q505G4 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms