Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZGD8

Nxf2, Nuclear RNA export factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nxf2Q4ZGD8 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nxf2Q4ZGD8 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nxf2Q4ZGD8 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nxf2Q4ZGD8 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nxf2Q4ZGD8 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nxf2Q4ZGD8 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nxf2Q4ZGD8 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nxf2Q4ZGD8 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nxf2Q4ZGD8 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nxf2Q4ZGD8 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nxf2Q4ZGD8 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nxf2Q4ZGD8 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nxf2Q4ZGD8 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nxf2Q4ZGD8 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nxf2Q4ZGD8 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nxf2Q4ZGD8 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nxf2Q4ZGD8 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nxf2Q4ZGD8 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nxf2Q4ZGD8 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nxf2Q4ZGD8 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nxf2Q4ZGD8 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nxf2Q4ZGD8 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nxf2Q4ZGD8 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nxf2Q4ZGD8 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nxf2Q4ZGD8 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nxf2Q4ZGD8 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nxf2Q4ZGD8 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nxf2Q4ZGD8 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nxf2Q4ZGD8 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nxf2Q4ZGD8 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nxf2Q4ZGD8 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nxf2Q4ZGD8 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nxf2Q4ZGD8 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nxf2Q4ZGD8 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nxf2Q4ZGD8 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nxf2Q4ZGD8 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nxf2Q4ZGD8 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nxf2Q4ZGD8 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nxf2Q4ZGD8 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nxf2Q4ZGD8 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nxf2Q4ZGD8 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Nxf2Q4ZGD8 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nxf2Q4ZGD8 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nxf2Q4ZGD8 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nxf2Q4ZGD8 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nxf2Q4ZGD8 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nxf2Q4ZGD8 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nxf2Q4ZGD8 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nxf2Q4ZGD8 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nxf2Q4ZGD8 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nxf2Q4ZGD8 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nxf2Q4ZGD8 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nxf2Q4ZGD8 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nxf2Q4ZGD8 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nxf2Q4ZGD8 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nxf2Q4ZGD8 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nxf2Q4ZGD8 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nxf2Q4ZGD8 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nxf2Q4ZGD8 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nxf2Q4ZGD8 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nxf2Q4ZGD8 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nxf2Q4ZGD8 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nxf2Q4ZGD8 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nxf2Q4ZGD8 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nxf2Q4ZGD8 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Nxf2Q4ZGD8 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nxf2Q4ZGD8 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nxf2Q4ZGD8 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nxf2Q4ZGD8 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nxf2Q4ZGD8 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nxf2Q4ZGD8 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nxf2Q4ZGD8 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nxf2Q4ZGD8 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nxf2Q4ZGD8 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nxf2Q4ZGD8 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nxf2Q4ZGD8 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nxf2Q4ZGD8 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nxf2Q4ZGD8 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nxf2Q4ZGD8 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Nxf2Q4ZGD8 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nxf2Q4ZGD8 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nxf2Q4ZGD8 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nxf2Q4ZGD8 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nxf2Q4ZGD8 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nxf2Q4ZGD8 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nxf2Q4ZGD8 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nxf2Q4ZGD8 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nxf2Q4ZGD8 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nxf2Q4ZGD8 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nxf2Q4ZGD8 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nxf2Q4ZGD8 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nxf2Q4ZGD8 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nxf2Q4ZGD8 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nxf2Q4ZGD8 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nxf2Q4ZGD8 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Nxf2Q4ZGD8 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nxf2Q4ZGD8 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nxf2Q4ZGD8 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Nxf2Q4ZGD8 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nxf2Q4ZGD8 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms