Protein–RNA interactions for Protein: Q4TU90

Rhox3a, Reproductive homeobox 3A, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox3aQ4TU90 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rhox3aQ4TU90 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rhox3aQ4TU90 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rhox3aQ4TU90 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rhox3aQ4TU90 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rhox3aQ4TU90 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rhox3aQ4TU90 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rhox3aQ4TU90 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rhox3aQ4TU90 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rhox3aQ4TU90 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rhox3aQ4TU90 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rhox3aQ4TU90 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rhox3aQ4TU90 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rhox3aQ4TU90 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rhox3aQ4TU90 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rhox3aQ4TU90 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rhox3aQ4TU90 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rhox3aQ4TU90 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rhox3aQ4TU90 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhox3aQ4TU90 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhox3aQ4TU90 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhox3aQ4TU90 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhox3aQ4TU90 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhox3aQ4TU90 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhox3aQ4TU90 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhox3aQ4TU90 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhox3aQ4TU90 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhox3aQ4TU90 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhox3aQ4TU90 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhox3aQ4TU90 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhox3aQ4TU90 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhox3aQ4TU90 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhox3aQ4TU90 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhox3aQ4TU90 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhox3aQ4TU90 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhox3aQ4TU90 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhox3aQ4TU90 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhox3aQ4TU90 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhox3aQ4TU90 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhox3aQ4TU90 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhox3aQ4TU90 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhox3aQ4TU90 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rhox3aQ4TU90 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rhox3aQ4TU90 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rhox3aQ4TU90 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rhox3aQ4TU90 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rhox3aQ4TU90 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rhox3aQ4TU90 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rhox3aQ4TU90 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rhox3aQ4TU90 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rhox3aQ4TU90 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rhox3aQ4TU90 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rhox3aQ4TU90 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rhox3aQ4TU90 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rhox3aQ4TU90 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rhox3aQ4TU90 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rhox3aQ4TU90 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rhox3aQ4TU90 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rhox3aQ4TU90 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rhox3aQ4TU90 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rhox3aQ4TU90 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rhox3aQ4TU90 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rhox3aQ4TU90 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rhox3aQ4TU90 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rhox3aQ4TU90 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rhox3aQ4TU90 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rhox3aQ4TU90 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rhox3aQ4TU90 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rhox3aQ4TU90 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rhox3aQ4TU90 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rhox3aQ4TU90 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rhox3aQ4TU90 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rhox3aQ4TU90 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rhox3aQ4TU90 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rhox3aQ4TU90 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rhox3aQ4TU90 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rhox3aQ4TU90 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rhox3aQ4TU90 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rhox3aQ4TU90 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rhox3aQ4TU90 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rhox3aQ4TU90 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rhox3aQ4TU90 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rhox3aQ4TU90 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rhox3aQ4TU90 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rhox3aQ4TU90 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rhox3aQ4TU90 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rhox3aQ4TU90 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rhox3aQ4TU90 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rhox3aQ4TU90 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rhox3aQ4TU90 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rhox3aQ4TU90 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rhox3aQ4TU90 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rhox3aQ4TU90 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rhox3aQ4TU90 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rhox3aQ4TU90 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rhox3aQ4TU90 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rhox3aQ4TU90 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rhox3aQ4TU90 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rhox3aQ4TU90 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rhox3aQ4TU90 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms