Protein–RNA interactions for Protein: Q4QQM4

Trp53i11, Tumor protein p53-inducible protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53i11Q4QQM4 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Trp53i11Q4QQM4 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trp53i11Q4QQM4 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Trp53i11Q4QQM4 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trp53i11Q4QQM4 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trp53i11Q4QQM4 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trp53i11Q4QQM4 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trp53i11Q4QQM4 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trp53i11Q4QQM4 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trp53i11Q4QQM4 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trp53i11Q4QQM4 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trp53i11Q4QQM4 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trp53i11Q4QQM4 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trp53i11Q4QQM4 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trp53i11Q4QQM4 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trp53i11Q4QQM4 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trp53i11Q4QQM4 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trp53i11Q4QQM4 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trp53i11Q4QQM4 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trp53i11Q4QQM4 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trp53i11Q4QQM4 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trp53i11Q4QQM4 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trp53i11Q4QQM4 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trp53i11Q4QQM4 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Trp53i11Q4QQM4 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trp53i11Q4QQM4 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Trp53i11Q4QQM4 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trp53i11Q4QQM4 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trp53i11Q4QQM4 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Trp53i11Q4QQM4 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trp53i11Q4QQM4 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trp53i11Q4QQM4 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trp53i11Q4QQM4 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trp53i11Q4QQM4 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Trp53i11Q4QQM4 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trp53i11Q4QQM4 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trp53i11Q4QQM4 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trp53i11Q4QQM4 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trp53i11Q4QQM4 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trp53i11Q4QQM4 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trp53i11Q4QQM4 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trp53i11Q4QQM4 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trp53i11Q4QQM4 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trp53i11Q4QQM4 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trp53i11Q4QQM4 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trp53i11Q4QQM4 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Trp53i11Q4QQM4 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trp53i11Q4QQM4 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trp53i11Q4QQM4 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Trp53i11Q4QQM4 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Trp53i11Q4QQM4 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trp53i11Q4QQM4 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Trp53i11Q4QQM4 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Trp53i11Q4QQM4 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trp53i11Q4QQM4 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02■□□□□ -0
Trp53i11Q4QQM4 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trp53i11Q4QQM4 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trp53i11Q4QQM4 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trp53i11Q4QQM4 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trp53i11Q4QQM4 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trp53i11Q4QQM4 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trp53i11Q4QQM4 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trp53i11Q4QQM4 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trp53i11Q4QQM4 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trp53i11Q4QQM4 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trp53i11Q4QQM4 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trp53i11Q4QQM4 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trp53i11Q4QQM4 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trp53i11Q4QQM4 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trp53i11Q4QQM4 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trp53i11Q4QQM4 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trp53i11Q4QQM4 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trp53i11Q4QQM4 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trp53i11Q4QQM4 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trp53i11Q4QQM4 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trp53i11Q4QQM4 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trp53i11Q4QQM4 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trp53i11Q4QQM4 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trp53i11Q4QQM4 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trp53i11Q4QQM4 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trp53i11Q4QQM4 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trp53i11Q4QQM4 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trp53i11Q4QQM4 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Trp53i11Q4QQM4 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trp53i11Q4QQM4 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trp53i11Q4QQM4 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trp53i11Q4QQM4 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trp53i11Q4QQM4 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trp53i11Q4QQM4 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trp53i11Q4QQM4 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Trp53i11Q4QQM4 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trp53i11Q4QQM4 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trp53i11Q4QQM4 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trp53i11Q4QQM4 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trp53i11Q4QQM4 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Trp53i11Q4QQM4 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trp53i11Q4QQM4 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Trp53i11Q4QQM4 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trp53i11Q4QQM4 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trp53i11Q4QQM4 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms