Protein–RNA interactions for Protein: Q499M4

Tigd5, Tigger transposable element derived 5, mousemouse

Predictions only

Length 642 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tigd5Q499M4 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tigd5Q499M4 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tigd5Q499M4 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tigd5Q499M4 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tigd5Q499M4 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Tigd5Q499M4 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tigd5Q499M4 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tigd5Q499M4 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tigd5Q499M4 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Tigd5Q499M4 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Tigd5Q499M4 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tigd5Q499M4 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tigd5Q499M4 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tigd5Q499M4 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tigd5Q499M4 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tigd5Q499M4 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tigd5Q499M4 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tigd5Q499M4 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tigd5Q499M4 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tigd5Q499M4 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tigd5Q499M4 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tigd5Q499M4 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tigd5Q499M4 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tigd5Q499M4 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tigd5Q499M4 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tigd5Q499M4 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tigd5Q499M4 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tigd5Q499M4 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tigd5Q499M4 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tigd5Q499M4 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tigd5Q499M4 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Tigd5Q499M4 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Tigd5Q499M4 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Tigd5Q499M4 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Tigd5Q499M4 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tigd5Q499M4 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tigd5Q499M4 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Tigd5Q499M4 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Tigd5Q499M4 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tigd5Q499M4 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tigd5Q499M4 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tigd5Q499M4 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tigd5Q499M4 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tigd5Q499M4 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tigd5Q499M4 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tigd5Q499M4 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tigd5Q499M4 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Tigd5Q499M4 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tigd5Q499M4 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tigd5Q499M4 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tigd5Q499M4 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tigd5Q499M4 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tigd5Q499M4 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tigd5Q499M4 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Tigd5Q499M4 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tigd5Q499M4 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tigd5Q499M4 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tigd5Q499M4 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tigd5Q499M4 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tigd5Q499M4 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tigd5Q499M4 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tigd5Q499M4 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tigd5Q499M4 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tigd5Q499M4 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tigd5Q499M4 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tigd5Q499M4 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tigd5Q499M4 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tigd5Q499M4 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tigd5Q499M4 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tigd5Q499M4 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tigd5Q499M4 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Tigd5Q499M4 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tigd5Q499M4 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tigd5Q499M4 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Tigd5Q499M4 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Tigd5Q499M4 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tigd5Q499M4 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Tigd5Q499M4 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tigd5Q499M4 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tigd5Q499M4 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tigd5Q499M4 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tigd5Q499M4 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tigd5Q499M4 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tigd5Q499M4 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tigd5Q499M4 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tigd5Q499M4 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tigd5Q499M4 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tigd5Q499M4 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tigd5Q499M4 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tigd5Q499M4 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tigd5Q499M4 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tigd5Q499M4 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tigd5Q499M4 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tigd5Q499M4 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tigd5Q499M4 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tigd5Q499M4 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tigd5Q499M4 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tigd5Q499M4 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tigd5Q499M4 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tigd5Q499M4 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms