Protein–RNA interactions for Protein: Q3V460

Smim26, Gene model 561, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim26Q3V460 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim26Q3V460 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim26Q3V460 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim26Q3V460 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim26Q3V460 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim26Q3V460 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim26Q3V460 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim26Q3V460 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim26Q3V460 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim26Q3V460 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim26Q3V460 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim26Q3V460 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim26Q3V460 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim26Q3V460 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim26Q3V460 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim26Q3V460 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim26Q3V460 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim26Q3V460 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim26Q3V460 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim26Q3V460 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim26Q3V460 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim26Q3V460 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim26Q3V460 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim26Q3V460 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim26Q3V460 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim26Q3V460 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim26Q3V460 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim26Q3V460 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim26Q3V460 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim26Q3V460 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim26Q3V460 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim26Q3V460 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim26Q3V460 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim26Q3V460 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim26Q3V460 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim26Q3V460 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim26Q3V460 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim26Q3V460 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim26Q3V460 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim26Q3V460 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim26Q3V460 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim26Q3V460 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim26Q3V460 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim26Q3V460 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim26Q3V460 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim26Q3V460 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim26Q3V460 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim26Q3V460 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim26Q3V460 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim26Q3V460 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim26Q3V460 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim26Q3V460 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim26Q3V460 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim26Q3V460 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim26Q3V460 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim26Q3V460 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim26Q3V460 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim26Q3V460 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim26Q3V460 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim26Q3V460 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim26Q3V460 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim26Q3V460 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim26Q3V460 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim26Q3V460 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim26Q3V460 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim26Q3V460 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim26Q3V460 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim26Q3V460 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim26Q3V460 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim26Q3V460 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim26Q3V460 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim26Q3V460 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim26Q3V460 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim26Q3V460 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim26Q3V460 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim26Q3V460 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim26Q3V460 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim26Q3V460 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim26Q3V460 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim26Q3V460 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim26Q3V460 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim26Q3V460 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim26Q3V460 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim26Q3V460 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim26Q3V460 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim26Q3V460 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim26Q3V460 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim26Q3V460 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim26Q3V460 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim26Q3V460 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim26Q3V460 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim26Q3V460 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim26Q3V460 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim26Q3V460 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim26Q3V460 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim26Q3V460 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim26Q3V460 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim26Q3V460 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim26Q3V460 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim26Q3V460 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms