Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0Q7

Tmprss12, Transmembrane protease serine 12, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmprss12Q3V0Q7 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmprss12Q3V0Q7 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmprss12Q3V0Q7 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmprss12Q3V0Q7 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmprss12Q3V0Q7 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmprss12Q3V0Q7 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmprss12Q3V0Q7 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmprss12Q3V0Q7 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmprss12Q3V0Q7 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmprss12Q3V0Q7 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmprss12Q3V0Q7 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Tmprss12Q3V0Q7 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Tmprss12Q3V0Q7 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Tmprss12Q3V0Q7 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Tmprss12Q3V0Q7 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmprss12Q3V0Q7 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmprss12Q3V0Q7 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmprss12Q3V0Q7 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmprss12Q3V0Q7 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmprss12Q3V0Q7 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmprss12Q3V0Q7 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmprss12Q3V0Q7 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmprss12Q3V0Q7 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmprss12Q3V0Q7 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmprss12Q3V0Q7 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmprss12Q3V0Q7 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmprss12Q3V0Q7 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmprss12Q3V0Q7 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmprss12Q3V0Q7 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmprss12Q3V0Q7 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmprss12Q3V0Q7 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmprss12Q3V0Q7 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmprss12Q3V0Q7 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmprss12Q3V0Q7 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmprss12Q3V0Q7 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmprss12Q3V0Q7 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmprss12Q3V0Q7 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmprss12Q3V0Q7 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmprss12Q3V0Q7 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmprss12Q3V0Q7 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmprss12Q3V0Q7 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmprss12Q3V0Q7 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmprss12Q3V0Q7 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmprss12Q3V0Q7 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmprss12Q3V0Q7 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmprss12Q3V0Q7 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmprss12Q3V0Q7 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmprss12Q3V0Q7 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmprss12Q3V0Q7 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmprss12Q3V0Q7 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmprss12Q3V0Q7 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmprss12Q3V0Q7 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmprss12Q3V0Q7 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmprss12Q3V0Q7 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmprss12Q3V0Q7 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmprss12Q3V0Q7 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmprss12Q3V0Q7 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmprss12Q3V0Q7 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmprss12Q3V0Q7 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmprss12Q3V0Q7 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmprss12Q3V0Q7 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmprss12Q3V0Q7 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmprss12Q3V0Q7 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmprss12Q3V0Q7 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmprss12Q3V0Q7 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmprss12Q3V0Q7 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmprss12Q3V0Q7 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmprss12Q3V0Q7 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmprss12Q3V0Q7 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmprss12Q3V0Q7 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmprss12Q3V0Q7 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmprss12Q3V0Q7 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmprss12Q3V0Q7 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmprss12Q3V0Q7 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmprss12Q3V0Q7 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmprss12Q3V0Q7 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmprss12Q3V0Q7 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmprss12Q3V0Q7 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmprss12Q3V0Q7 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmprss12Q3V0Q7 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmprss12Q3V0Q7 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmprss12Q3V0Q7 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmprss12Q3V0Q7 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmprss12Q3V0Q7 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmprss12Q3V0Q7 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmprss12Q3V0Q7 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmprss12Q3V0Q7 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmprss12Q3V0Q7 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmprss12Q3V0Q7 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmprss12Q3V0Q7 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmprss12Q3V0Q7 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmprss12Q3V0Q7 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmprss12Q3V0Q7 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmprss12Q3V0Q7 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmprss12Q3V0Q7 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmprss12Q3V0Q7 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmprss12Q3V0Q7 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmprss12Q3V0Q7 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmprss12Q3V0Q7 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmprss12Q3V0Q7 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms