Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYG1

Ccdc160, Coiled-coil domain-containing protein 160, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc160Q3UYG1 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc160Q3UYG1 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc160Q3UYG1 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc160Q3UYG1 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc160Q3UYG1 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc160Q3UYG1 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc160Q3UYG1 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc160Q3UYG1 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc160Q3UYG1 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc160Q3UYG1 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc160Q3UYG1 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc160Q3UYG1 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc160Q3UYG1 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc160Q3UYG1 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc160Q3UYG1 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc160Q3UYG1 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc160Q3UYG1 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc160Q3UYG1 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc160Q3UYG1 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc160Q3UYG1 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc160Q3UYG1 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc160Q3UYG1 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc160Q3UYG1 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc160Q3UYG1 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc160Q3UYG1 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc160Q3UYG1 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc160Q3UYG1 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc160Q3UYG1 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc160Q3UYG1 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc160Q3UYG1 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc160Q3UYG1 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc160Q3UYG1 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc160Q3UYG1 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc160Q3UYG1 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc160Q3UYG1 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc160Q3UYG1 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc160Q3UYG1 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc160Q3UYG1 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc160Q3UYG1 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc160Q3UYG1 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc160Q3UYG1 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc160Q3UYG1 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc160Q3UYG1 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc160Q3UYG1 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc160Q3UYG1 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc160Q3UYG1 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc160Q3UYG1 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc160Q3UYG1 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc160Q3UYG1 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc160Q3UYG1 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc160Q3UYG1 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc160Q3UYG1 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc160Q3UYG1 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc160Q3UYG1 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc160Q3UYG1 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc160Q3UYG1 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc160Q3UYG1 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc160Q3UYG1 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc160Q3UYG1 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc160Q3UYG1 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc160Q3UYG1 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc160Q3UYG1 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc160Q3UYG1 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc160Q3UYG1 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc160Q3UYG1 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc160Q3UYG1 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc160Q3UYG1 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc160Q3UYG1 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc160Q3UYG1 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc160Q3UYG1 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc160Q3UYG1 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc160Q3UYG1 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc160Q3UYG1 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc160Q3UYG1 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc160Q3UYG1 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc160Q3UYG1 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc160Q3UYG1 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc160Q3UYG1 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc160Q3UYG1 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc160Q3UYG1 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc160Q3UYG1 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc160Q3UYG1 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc160Q3UYG1 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc160Q3UYG1 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc160Q3UYG1 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc160Q3UYG1 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc160Q3UYG1 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc160Q3UYG1 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc160Q3UYG1 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc160Q3UYG1 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc160Q3UYG1 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc160Q3UYG1 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc160Q3UYG1 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc160Q3UYG1 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc160Q3UYG1 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc160Q3UYG1 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc160Q3UYG1 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc160Q3UYG1 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc160Q3UYG1 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc160Q3UYG1 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms