Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC10.8□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms