Protein–RNA interactions for Protein: Q3UN04

Usp30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp30Q3UN04 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp30Q3UN04 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp30Q3UN04 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp30Q3UN04 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp30Q3UN04 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp30Q3UN04 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp30Q3UN04 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp30Q3UN04 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp30Q3UN04 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp30Q3UN04 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp30Q3UN04 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp30Q3UN04 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp30Q3UN04 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp30Q3UN04 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp30Q3UN04 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp30Q3UN04 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp30Q3UN04 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp30Q3UN04 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp30Q3UN04 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp30Q3UN04 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp30Q3UN04 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp30Q3UN04 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp30Q3UN04 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp30Q3UN04 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp30Q3UN04 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp30Q3UN04 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp30Q3UN04 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp30Q3UN04 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp30Q3UN04 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp30Q3UN04 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp30Q3UN04 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp30Q3UN04 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp30Q3UN04 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp30Q3UN04 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp30Q3UN04 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp30Q3UN04 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp30Q3UN04 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp30Q3UN04 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp30Q3UN04 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp30Q3UN04 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp30Q3UN04 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp30Q3UN04 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp30Q3UN04 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp30Q3UN04 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp30Q3UN04 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp30Q3UN04 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp30Q3UN04 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp30Q3UN04 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp30Q3UN04 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp30Q3UN04 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp30Q3UN04 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp30Q3UN04 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp30Q3UN04 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp30Q3UN04 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp30Q3UN04 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp30Q3UN04 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp30Q3UN04 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp30Q3UN04 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp30Q3UN04 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp30Q3UN04 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp30Q3UN04 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp30Q3UN04 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp30Q3UN04 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp30Q3UN04 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp30Q3UN04 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp30Q3UN04 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp30Q3UN04 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp30Q3UN04 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp30Q3UN04 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp30Q3UN04 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp30Q3UN04 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp30Q3UN04 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp30Q3UN04 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp30Q3UN04 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp30Q3UN04 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp30Q3UN04 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp30Q3UN04 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp30Q3UN04 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp30Q3UN04 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp30Q3UN04 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp30Q3UN04 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp30Q3UN04 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp30Q3UN04 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp30Q3UN04 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp30Q3UN04 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp30Q3UN04 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp30Q3UN04 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp30Q3UN04 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp30Q3UN04 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp30Q3UN04 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Usp30Q3UN04 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Usp30Q3UN04 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Usp30Q3UN04 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Usp30Q3UN04 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Usp30Q3UN04 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Usp30Q3UN04 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Usp30Q3UN04 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Usp30Q3UN04 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp30Q3UN04 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp30Q3UN04 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms