Protein–RNA interactions for Protein: Q3U9G9

Lbr, Lamin-B receptor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 626 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LbrQ3U9G9 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LbrQ3U9G9 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LbrQ3U9G9 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LbrQ3U9G9 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
LbrQ3U9G9 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LbrQ3U9G9 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LbrQ3U9G9 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
LbrQ3U9G9 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LbrQ3U9G9 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LbrQ3U9G9 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LbrQ3U9G9 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LbrQ3U9G9 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
LbrQ3U9G9 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LbrQ3U9G9 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LbrQ3U9G9 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LbrQ3U9G9 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LbrQ3U9G9 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LbrQ3U9G9 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LbrQ3U9G9 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LbrQ3U9G9 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LbrQ3U9G9 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LbrQ3U9G9 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LbrQ3U9G9 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
LbrQ3U9G9 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
LbrQ3U9G9 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
LbrQ3U9G9 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
LbrQ3U9G9 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LbrQ3U9G9 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LbrQ3U9G9 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LbrQ3U9G9 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LbrQ3U9G9 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LbrQ3U9G9 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LbrQ3U9G9 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LbrQ3U9G9 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LbrQ3U9G9 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LbrQ3U9G9 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LbrQ3U9G9 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LbrQ3U9G9 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
LbrQ3U9G9 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
LbrQ3U9G9 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LbrQ3U9G9 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LbrQ3U9G9 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LbrQ3U9G9 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LbrQ3U9G9 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LbrQ3U9G9 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LbrQ3U9G9 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LbrQ3U9G9 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LbrQ3U9G9 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LbrQ3U9G9 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LbrQ3U9G9 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LbrQ3U9G9 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LbrQ3U9G9 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LbrQ3U9G9 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LbrQ3U9G9 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LbrQ3U9G9 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LbrQ3U9G9 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LbrQ3U9G9 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LbrQ3U9G9 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LbrQ3U9G9 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
LbrQ3U9G9 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LbrQ3U9G9 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
LbrQ3U9G9 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LbrQ3U9G9 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LbrQ3U9G9 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LbrQ3U9G9 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LbrQ3U9G9 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LbrQ3U9G9 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LbrQ3U9G9 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LbrQ3U9G9 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LbrQ3U9G9 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LbrQ3U9G9 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LbrQ3U9G9 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LbrQ3U9G9 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LbrQ3U9G9 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LbrQ3U9G9 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
LbrQ3U9G9 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LbrQ3U9G9 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LbrQ3U9G9 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LbrQ3U9G9 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LbrQ3U9G9 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LbrQ3U9G9 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LbrQ3U9G9 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LbrQ3U9G9 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
LbrQ3U9G9 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
LbrQ3U9G9 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LbrQ3U9G9 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LbrQ3U9G9 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
LbrQ3U9G9 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LbrQ3U9G9 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LbrQ3U9G9 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LbrQ3U9G9 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
LbrQ3U9G9 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LbrQ3U9G9 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LbrQ3U9G9 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LbrQ3U9G9 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LbrQ3U9G9 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LbrQ3U9G9 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LbrQ3U9G9 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LbrQ3U9G9 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LbrQ3U9G9 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms