Protein–RNA interactions for Protein: Q3TSG4

Alkbh5, RNA demethylase ALKBH5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh5Q3TSG4 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Alkbh5Q3TSG4 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Alkbh5Q3TSG4 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Alkbh5Q3TSG4 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Alkbh5Q3TSG4 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Alkbh5Q3TSG4 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Alkbh5Q3TSG4 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Alkbh5Q3TSG4 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Alkbh5Q3TSG4 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Alkbh5Q3TSG4 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Alkbh5Q3TSG4 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Alkbh5Q3TSG4 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Alkbh5Q3TSG4 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Alkbh5Q3TSG4 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Alkbh5Q3TSG4 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Alkbh5Q3TSG4 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Alkbh5Q3TSG4 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Alkbh5Q3TSG4 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Alkbh5Q3TSG4 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Alkbh5Q3TSG4 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Alkbh5Q3TSG4 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Alkbh5Q3TSG4 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Alkbh5Q3TSG4 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Alkbh5Q3TSG4 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Alkbh5Q3TSG4 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Alkbh5Q3TSG4 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Alkbh5Q3TSG4 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Alkbh5Q3TSG4 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Alkbh5Q3TSG4 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Alkbh5Q3TSG4 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Alkbh5Q3TSG4 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Alkbh5Q3TSG4 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Alkbh5Q3TSG4 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Alkbh5Q3TSG4 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Alkbh5Q3TSG4 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Alkbh5Q3TSG4 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Alkbh5Q3TSG4 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Alkbh5Q3TSG4 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Alkbh5Q3TSG4 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Alkbh5Q3TSG4 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Alkbh5Q3TSG4 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Alkbh5Q3TSG4 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Alkbh5Q3TSG4 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Alkbh5Q3TSG4 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Alkbh5Q3TSG4 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Alkbh5Q3TSG4 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Alkbh5Q3TSG4 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Alkbh5Q3TSG4 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Alkbh5Q3TSG4 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Alkbh5Q3TSG4 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Alkbh5Q3TSG4 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Alkbh5Q3TSG4 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Alkbh5Q3TSG4 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Alkbh5Q3TSG4 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Alkbh5Q3TSG4 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Alkbh5Q3TSG4 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Alkbh5Q3TSG4 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Alkbh5Q3TSG4 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Alkbh5Q3TSG4 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Alkbh5Q3TSG4 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Alkbh5Q3TSG4 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Alkbh5Q3TSG4 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Alkbh5Q3TSG4 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Alkbh5Q3TSG4 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Alkbh5Q3TSG4 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Alkbh5Q3TSG4 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Alkbh5Q3TSG4 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Alkbh5Q3TSG4 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Alkbh5Q3TSG4 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Alkbh5Q3TSG4 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Alkbh5Q3TSG4 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Alkbh5Q3TSG4 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Alkbh5Q3TSG4 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Alkbh5Q3TSG4 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Alkbh5Q3TSG4 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Alkbh5Q3TSG4 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Alkbh5Q3TSG4 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Alkbh5Q3TSG4 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Alkbh5Q3TSG4 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Alkbh5Q3TSG4 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Alkbh5Q3TSG4 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Alkbh5Q3TSG4 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Alkbh5Q3TSG4 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Alkbh5Q3TSG4 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Alkbh5Q3TSG4 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Alkbh5Q3TSG4 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Alkbh5Q3TSG4 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Alkbh5Q3TSG4 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Alkbh5Q3TSG4 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Alkbh5Q3TSG4 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Alkbh5Q3TSG4 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Alkbh5Q3TSG4 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Alkbh5Q3TSG4 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Alkbh5Q3TSG4 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Alkbh5Q3TSG4 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Alkbh5Q3TSG4 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Alkbh5Q3TSG4 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Alkbh5Q3TSG4 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Alkbh5Q3TSG4 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Alkbh5Q3TSG4 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms