Protein–RNA interactions for Protein: Q3TC46

Patl1, Protein PAT1 homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Patl1Q3TC46 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Patl1Q3TC46 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Patl1Q3TC46 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Patl1Q3TC46 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Patl1Q3TC46 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Patl1Q3TC46 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Patl1Q3TC46 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Patl1Q3TC46 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Patl1Q3TC46 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Patl1Q3TC46 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Patl1Q3TC46 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Patl1Q3TC46 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Patl1Q3TC46 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Patl1Q3TC46 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Patl1Q3TC46 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Patl1Q3TC46 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Patl1Q3TC46 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Patl1Q3TC46 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Patl1Q3TC46 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Patl1Q3TC46 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Patl1Q3TC46 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Patl1Q3TC46 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Patl1Q3TC46 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Patl1Q3TC46 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Patl1Q3TC46 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Patl1Q3TC46 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Patl1Q3TC46 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Patl1Q3TC46 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Patl1Q3TC46 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Patl1Q3TC46 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Patl1Q3TC46 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Patl1Q3TC46 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Patl1Q3TC46 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Patl1Q3TC46 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Patl1Q3TC46 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Patl1Q3TC46 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Patl1Q3TC46 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Patl1Q3TC46 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Patl1Q3TC46 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Patl1Q3TC46 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Patl1Q3TC46 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Patl1Q3TC46 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Patl1Q3TC46 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Patl1Q3TC46 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Patl1Q3TC46 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Patl1Q3TC46 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Patl1Q3TC46 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Patl1Q3TC46 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Patl1Q3TC46 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Patl1Q3TC46 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Patl1Q3TC46 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Patl1Q3TC46 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Patl1Q3TC46 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Patl1Q3TC46 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Patl1Q3TC46 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Patl1Q3TC46 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Patl1Q3TC46 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Patl1Q3TC46 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Patl1Q3TC46 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Patl1Q3TC46 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Patl1Q3TC46 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Patl1Q3TC46 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Patl1Q3TC46 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Patl1Q3TC46 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Patl1Q3TC46 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Patl1Q3TC46 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Patl1Q3TC46 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Patl1Q3TC46 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Patl1Q3TC46 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Patl1Q3TC46 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Patl1Q3TC46 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Patl1Q3TC46 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Patl1Q3TC46 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Patl1Q3TC46 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Patl1Q3TC46 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Patl1Q3TC46 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Patl1Q3TC46 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Patl1Q3TC46 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Patl1Q3TC46 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Patl1Q3TC46 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Patl1Q3TC46 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Patl1Q3TC46 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Patl1Q3TC46 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Patl1Q3TC46 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Patl1Q3TC46 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Patl1Q3TC46 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Patl1Q3TC46 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Patl1Q3TC46 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Patl1Q3TC46 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Patl1Q3TC46 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Patl1Q3TC46 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Patl1Q3TC46 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Patl1Q3TC46 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Patl1Q3TC46 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Patl1Q3TC46 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Patl1Q3TC46 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Patl1Q3TC46 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Patl1Q3TC46 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Patl1Q3TC46 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Patl1Q3TC46 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms