Protein–RNA interactions for Protein: Q3TC33

Ccdc127, Coiled-coil domain-containing protein 127, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc127Q3TC33 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc127Q3TC33 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc127Q3TC33 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc127Q3TC33 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc127Q3TC33 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc127Q3TC33 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc127Q3TC33 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc127Q3TC33 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc127Q3TC33 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc127Q3TC33 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc127Q3TC33 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc127Q3TC33 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc127Q3TC33 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc127Q3TC33 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc127Q3TC33 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc127Q3TC33 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc127Q3TC33 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc127Q3TC33 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc127Q3TC33 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc127Q3TC33 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc127Q3TC33 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc127Q3TC33 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc127Q3TC33 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc127Q3TC33 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc127Q3TC33 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc127Q3TC33 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc127Q3TC33 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc127Q3TC33 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc127Q3TC33 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc127Q3TC33 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc127Q3TC33 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc127Q3TC33 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc127Q3TC33 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc127Q3TC33 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc127Q3TC33 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc127Q3TC33 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc127Q3TC33 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc127Q3TC33 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc127Q3TC33 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc127Q3TC33 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc127Q3TC33 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc127Q3TC33 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc127Q3TC33 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc127Q3TC33 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc127Q3TC33 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc127Q3TC33 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc127Q3TC33 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc127Q3TC33 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc127Q3TC33 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc127Q3TC33 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc127Q3TC33 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc127Q3TC33 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc127Q3TC33 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc127Q3TC33 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc127Q3TC33 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc127Q3TC33 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc127Q3TC33 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc127Q3TC33 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc127Q3TC33 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc127Q3TC33 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc127Q3TC33 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc127Q3TC33 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc127Q3TC33 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc127Q3TC33 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc127Q3TC33 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc127Q3TC33 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc127Q3TC33 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc127Q3TC33 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc127Q3TC33 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc127Q3TC33 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc127Q3TC33 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc127Q3TC33 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc127Q3TC33 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc127Q3TC33 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc127Q3TC33 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc127Q3TC33 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc127Q3TC33 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc127Q3TC33 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc127Q3TC33 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc127Q3TC33 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc127Q3TC33 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc127Q3TC33 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc127Q3TC33 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc127Q3TC33 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc127Q3TC33 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc127Q3TC33 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc127Q3TC33 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc127Q3TC33 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc127Q3TC33 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc127Q3TC33 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc127Q3TC33 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc127Q3TC33 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc127Q3TC33 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc127Q3TC33 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc127Q3TC33 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc127Q3TC33 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc127Q3TC33 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc127Q3TC33 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc127Q3TC33 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc127Q3TC33 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms