Protein–RNA interactions for Protein: Q3LRV9

Treml4, Trem-like transcript 4 protein, mousemouse

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Length 263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Treml4Q3LRV9 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Treml4Q3LRV9 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Treml4Q3LRV9 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Treml4Q3LRV9 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Treml4Q3LRV9 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Treml4Q3LRV9 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Treml4Q3LRV9 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Treml4Q3LRV9 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Treml4Q3LRV9 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Treml4Q3LRV9 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Treml4Q3LRV9 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Treml4Q3LRV9 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Treml4Q3LRV9 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Treml4Q3LRV9 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Treml4Q3LRV9 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Treml4Q3LRV9 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Treml4Q3LRV9 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Treml4Q3LRV9 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Treml4Q3LRV9 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Treml4Q3LRV9 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Treml4Q3LRV9 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Treml4Q3LRV9 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Treml4Q3LRV9 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Treml4Q3LRV9 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Treml4Q3LRV9 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Treml4Q3LRV9 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Treml4Q3LRV9 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Treml4Q3LRV9 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Treml4Q3LRV9 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Treml4Q3LRV9 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Treml4Q3LRV9 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Treml4Q3LRV9 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Treml4Q3LRV9 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Treml4Q3LRV9 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Treml4Q3LRV9 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Treml4Q3LRV9 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Treml4Q3LRV9 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Treml4Q3LRV9 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Treml4Q3LRV9 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Treml4Q3LRV9 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Treml4Q3LRV9 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Treml4Q3LRV9 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Treml4Q3LRV9 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Treml4Q3LRV9 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Treml4Q3LRV9 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Treml4Q3LRV9 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Treml4Q3LRV9 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Treml4Q3LRV9 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Treml4Q3LRV9 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Treml4Q3LRV9 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Treml4Q3LRV9 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Treml4Q3LRV9 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Treml4Q3LRV9 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Treml4Q3LRV9 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Treml4Q3LRV9 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Treml4Q3LRV9 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Treml4Q3LRV9 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Treml4Q3LRV9 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Treml4Q3LRV9 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Treml4Q3LRV9 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Treml4Q3LRV9 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Treml4Q3LRV9 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Treml4Q3LRV9 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Treml4Q3LRV9 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Treml4Q3LRV9 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Treml4Q3LRV9 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Treml4Q3LRV9 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Treml4Q3LRV9 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Treml4Q3LRV9 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Treml4Q3LRV9 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Treml4Q3LRV9 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Treml4Q3LRV9 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Treml4Q3LRV9 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Treml4Q3LRV9 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Treml4Q3LRV9 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Treml4Q3LRV9 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Treml4Q3LRV9 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Treml4Q3LRV9 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Treml4Q3LRV9 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Treml4Q3LRV9 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Treml4Q3LRV9 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Treml4Q3LRV9 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Treml4Q3LRV9 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Treml4Q3LRV9 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Treml4Q3LRV9 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Treml4Q3LRV9 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Treml4Q3LRV9 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Treml4Q3LRV9 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Treml4Q3LRV9 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Treml4Q3LRV9 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Treml4Q3LRV9 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Treml4Q3LRV9 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Treml4Q3LRV9 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Treml4Q3LRV9 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Treml4Q3LRV9 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Treml4Q3LRV9 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Treml4Q3LRV9 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Treml4Q3LRV9 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Treml4Q3LRV9 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Treml4Q3LRV9 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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